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第七章 基因芯片数据分析 二、寡核苷酸芯片 　寡核苷酸芯片类似于cDNA芯片，但是在探针的设计上优于cDNA芯片，它的探针并不是来源于cDNA克隆，而是预先设计并合成的代表每个基因特异片段的约50mer左右长度的序列，然后将其点样到特定的基质上制备成芯片，从而克服了探针序列太长导致的非特异性交叉杂交和由于探针杂交条件变化巨大导致的数据结果的不可靠。 五、基因表达仓库 Gene Expression Omnibus，GEO 六、斯坦福微阵列数据库 The Stanford Microarray　 Database，SMD 第二节 基因芯片数据预处理(General Microarray Data Type and Database ) 数据过滤 数据过滤的目的是去除表达水平是负值或很小的数据、或者明显的噪声数据。 过闪耀现象 物理因素导致的信号污染 杂交效能低 点样问题 其它 二、数据补缺 (一)数据缺失类型 非随机缺失 基因表达丰度过高或过低 随机缺失 与基因表达丰度无关，数据 补缺主要针对随机缺失情况 (二)数据补缺方法 1、简单补缺法 2、K近邻法 3、回归法 三、数据标准化 (一)为什么要进行数据标准化 存在不同来源的系统误差 染料物理特性差异(热和光敏感性，半衰期等) 染料连接效能 点样针差异 数据收集过程