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浙江大李李银(农业与生命科学版)32(4):455^-459,2006
JournalofZhejiangUniversity(Agric.LifeSci.)
文章编号:1008-9209(2006)04-0455-05
濒危植物核心种质取样比率的蒙特卡罗模拟研究
李正宏 ，‘邱英雄 ，‘徐海明2，叶倩，，傅承新’
(1.浙江大学生命科学学院植物系统进化与生物多样性实验室，浙江杭州310029;2.浙江大学农学系，浙江杭州310029)
摘 要:针对濒危植物明党参ISSR数据以及八角莲和夏蜡梅的等位酶数据，以多态位点数(A)、多态
位点百分数(PPB)、居群内基因多样度(Hs)、群体总的基因多样度(Ht)、基因分化系数(Gst)以及捕获
的基因位点数为主要遗传多样性指标，利用蒙特卡罗模拟抽样法在各抽样比例下重复抽样1000次，并
构建了3个植物群体的基因捕获曲线与基因增量曲线.通过两种曲线的比较分析确定这3种濒危植物
的最佳取样比例皆为250o，但这并不意味着其他植物的最佳抽样比也为25% 此时明党参的多态位.点
数为163，多态位点百分数为40.85%0，基因多样度为0.2744;八角莲的多态位点数为12，多态位.点百分
数为32.43Yo，基因杂合度为0.1943;夏蜡梅的多态位点数为10，多态位点百分数为25%，基因杂合度
为0.0638，其各项遗传多样性指标与保护总群体95%遗传信息的样本非常相近.这说明通过蒙特卡罗
模拟抽样与基因捕获及增量曲线综合分析确定核心种质的最佳抽样比例客观合理、切实可行.
关 键 词:蒙特卡罗模拟;取样策略;遗传多样性;基因捕获曲线;基因增量曲线
中图分类号:Q943 文献标识码:A
LIZheng-bong，QIUYing-xiong，XUHai-ming2，YEQian，FUCheng-xin(1.Laboratoryof
SystematicandEvolutionaryBotanyandBiodiversity,CollegeofLifeSciences,ZhejiangUniversity,
Hangzhou310029,China;2.Dept.ofAgronomy,ZhejiangUniversity,Hangzhou310029,China)
StudyonthebestsamplingproportionforthecoreaccessionsoftheendangeredspeciesbyMonteCarlo
method.JournalofZhejiangUniversity(Agric.邑LifeSci.)，2006，32(4):455-459
Abstract:Numberofpolymorphicloci,thepercentageofpolymorphicloci,Hs,Ht,Gst,a叫the
numberofthecapturedgenesweretakenasthemainindicesofgeneticdiversity.1000sampleswere
createdbyusingMonteCarlomethodwithrespectivesamplingproportions(basedontheempiricaldata
from3endangeredplants:Changiumsmyrnioides，Dysosmaversipellis，Sinocalycanthuschinensis).
Aftersettingupandcomparingthegenecapturecurvesandgeneincreasingcurves,thebestsampling
proportionofC.smyrnioides，D.versipellisandS.chinensiscanbedetermined(allwere25%).Butit
nevermeansthatthebestsamplingproportionsofotherspeciesare250o.Onthislevel,polymorphicloci
numberofC.smyrnioideswas163,whichoccupied40.850o，andtheheterozygositywas0.274
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