蛋白质分子中的超二级结构.pptVIP

蛋白质分子的高级结构 二级结构概念 蛋白质的二级结构是指它的多肽链中有规则重复的构象。 氢键是稳定二级结构的主要作用力。 一些特定的二级结构的组合体就被称为超二级结构。 蛋白质的空间构象和维持构象的作用力 二面角 完全伸展的多肽主链构象 α－螺旋（α－helix） β－折叠（β-pleated sheet） β－转角（β-turn） 无规则卷曲示意图 二级结构的基本类型 β-转角及无规则卷曲 蛋白质超二级结构 Greek Key topology DOMAIN Superoxide Dismulase DOMAIN（1） 三种基本组合形式：αα，βαβ，βββ。 DOMAIN （2） Architecture（Horseshoe） DOMAIN （3） DOMAIN （4） Mainly Beta （Roll ） 　　　1C0M 1NH2 RNA polymerase 1EX4 DOMAIN （5） Clam Barrel Solenoid 4BCL 1PQ7 1K5C Endopolygalacturonase DOMAIN （6） Orthogonal Prism Trefoil Sandwich 1B2P（Sugar binding protein）1RG8 1JK4 DOMAIN （7） Aligned and Orthogonal Beta Sandwiches DOMAIN （8） 　　　　　　Greek Key topology（铜蛋白） DOMAIN （9） Gamma-crystallin （晶体球蛋白　1A5D ） DOMAIN （10） The Jellyroll Topology （蛋卷三明冶　C8N） DOMAIN （11） Beta Propellors （神经氨酸酶1B9T ）　 DOMAIN （12） Alpha and beta proteins (a/b) 1AY7 　　4FXN 1OBO DOMAIN （13） Alpha and beta proteins (a+b) 　　1MB1 1H6M Protein structures – different classes of protein structures Protein Tertiary Structure 维持蛋白质分子构象的作用力a.盐键 b.氢键 c.疏水键 d.范得华力 e.二硫键 肌红蛋白三级结构 Catalase A From Beef (bos taurus) liver （Ec: 1.11.1.6 ） Protein quaternary structure 血红蛋白四级结构 From Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii Active With Mn （1AR4） Fe-Sod From Aquifex Pyrophilus, A Hyperthermophilic Bacterium （1COJ ） 　　Human Erythrocyte Catalase(1DGB) Glutathione peroxidase (EC 1.11.1.9  PDB: 1GP1, 1PRX ) Thank you! 多肽键在二级结构的基础上，通过侧链基团的相互作用进一步卷曲折叠，借助次级键维系使α－螺旋、β－折叠片、β－转角等二级结构相互配置而形成特定的构象。三级结构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的重新排布。 　　实例：肌红蛋白 　　　 核糖核酸酶 多肽链 Yeast Cu/Zn Superoxide Dismutase （1B4L） 　　四级结构是指由相同或不同的称作亚基（subunit）的亚单位按照一定排布方式聚合而成的蛋白质结构，维持四级结构稳定的作用力主要是疏水键、离子键、氢键、范得华力等次级键。亚基本身都具有球状三级结构，一般只包含一条多肽链，也有的由二条或二条以上由二硫键连接