遗传学 第五章节 真核生物特殊的染色体作图资料文档.ppt

第五章 真核生物特殊的染色体作图 1 作图函数 1％的重组率被定义为一个遗传图距单位。 当位点间隔较小时，利用重组率可以合理估计遗传距离；当位点间的距离很大时，直接利用重组率估计遗传距离就很不准确。 作图函数反应的是重组率与实际遗传距离之间的关系 在某一特点染色体区域发生零次、一次、两次等不同类型交换的频率符合波松分布（poisson distribution）: f(i)=e-m mi/i! i是交换发生的次数；f(i)发生某一交换类型的频率，如f(1)、 f(2)等； e为自然对数的底；m是每个减数分裂细胞发生交换的平均次数； f(i)=1-e-m 因为发生交换后减数分裂产物的一半是重组型，所以重组频率 Rf=1/2(1-e-m) 若m很小时，Rf=1/2X m 2.真菌类的染色体作图 真菌和一次单细胞藻类特点： 每一个减数分裂细胞产生的四分子都被包含在一个孢囊状结构中，很容易被分离，从中可以对每一减数分裂的产物进行分析。 5.2.1 两个连锁基因的作图 对于无特定排列顺序的四分子遗传分析叫做－－无序四分子分析 ＋＋X ab 杂交组合的子囊中，四分子的基因型分为： 亲代双型（PD） 非亲代双型（NPD） 四型（TT） 当a，b不连锁时，PD与NPD 的频率相同； 当a，b连锁时， PD频率远远大于NPD 。同时，减数分裂中 a，b间可能发生不交换（NCO）,单交换（SCO）,双交换(DCO)等。 对于ab两位点间遗传作图的关键在于四线双交换产生的NPD类型。 如果四种双交换类型是随机的，双交换类型的频率为： DCO=4NPD SCO=TT-DCO=TT-2NPD 交换平均次数 m = SCO+2DCO= TT+6NPD 将m转为遗传图距单位 ： 图距＝1/2 m=1/2X(TT+6NPD) 5.2.2三个连锁基因的作图 假设acb是按顺序相互连锁的3个基因， ＋＋＋与acb杂交后，由于各种交换，会产生各种类型的四分孢子。 由于三次以上的交换发生的频率很低，所以仅仅考虑零次交换到二次交换的情况： 第一类（NCO）：产生的四分孢子全是亲本型（PD，亲代双型） 第二类:SCO(a-c,c-b),DCO(双线)，产生两种重组型孢子，两种亲本型孢子（TT,四型） 第三类:DCO(三线），产生三种重组型孢子，一种亲本型孢子（TT,四型） 第四类:DCO(四线)，产生全为重组型孢子（TT,四型） 确定基因顺序： 根据三点测验中，双线双交换恰好换掉中 间基因的特点，用DCO(双线)TT型，确定基因顺序。 遗传距离的估计： 校正后的遗传距离： 遗传图距＝1/2xm=1/2(TT+6NPD). 但数据中没有典型的非亲代双型（NPD）. 在三个连锁基因的作图，因为同时考虑三个基因位点间关系，所得到的观测值比两个基因连锁作图时，更接近真实遗传距离， 所以可以直接计算重组值： Rf(a-c)=1/2TT+NPD, 寻找a+/+c类型 Rf(b-c)=1/2TT+NPD，寻找c+/+b类型 M I模式：当基因与着丝粒之间没有交换时，一对等位基因在第一次减数分裂时分开，这种分离模式为M I模式。 四分子中排列方式为aa++, ++aa 八分子中排列方式为aaaa++++, ++++aaaa M II模式:当基因与着丝粒之间发生交换时，一对等位基因在第二次减数分裂时分开，这种分离模式为M II 模式。 四分子中排列方式为a+ a+, +a +a 八分子中排列方式为aa++ aa++, ++aa ++aa 例如：对红色面包霉线性八分子分析： 1. ++++aaaa 125 2. aaaa++++ 130 3. ++aa++aa 13 4. ++aaaa++ 9 5. aa++aa++ 12 6. aa++++aa 11 5.4 红色面包霉的两基因分离 如abX++杂交的子囊类型与数目：见书P114. 1.属于PD的子囊数目远远大于NPD子囊数目，说明a,b是连锁的。 2. a,b基因与着丝粒的交换并不独立。如当a与着丝粒交换时（MII), b与着丝粒也有交换（MII)，见第4组数据.说明，a,b在染色体的同一臂上。 3. 当a与着丝粒无交换时（MI), b与着丝粒却有交换（MII)，见第3组数据.说明，a在着丝粒与b之间。 4. a,b间遗传图距＝1/2(PD+6NPD)=19.4cM 如果直接计算重组值Rf=1/2TT+NPD=16cM 5.a与着丝粒间距离：1/2(60/400)=7.5cM 6.着丝粒与b间距离= a,b间遗传图距+ a与着丝粒间距离 * 5.3 红色面包霉染色体的着丝粒作图：