SSR分子标记剖析.pptVIP

专业综合能力训练与测试 利用SSR技术 进行玉米杂交种的纯度鉴定 2012.5 一、实验目的 玉米是我国的主要农业作物，利用SSR技术进行玉米种子纯度鉴定，已经筛选出多对可利用的引物，综合运用SSR核心引物和DNA指纹图谱，可以准确地鉴定父本、母本、混杂品种及真实杂交种，其鉴定结果与RFLP结果及系谱来源基本一致。 SSR标记的简介及原理 SSR标记的步骤及分析 SSR标记引物设计 二、SSR标记 1 2 3 SSR （simple sequence repeat） SSR标记 简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR），指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA，广泛分布于基因组的不同位置，长度一般在200 bp以下。 SSR标记是一种通过直接分析遗传物质的多态性来鉴别生物内在的核苷酸排布及其外在状态表现规律的技术。 1. SSR标记的简介 SSR分子标记的分子学基础 微卫星在真核生物的基因组中的含量非常丰富，而且常常是随机分布于核DNA中。在植物中通过对拟南芥、玉米、水稻、小麦等的研究表明微卫星在植物中也很丰富，均匀分布于整个植物基因组中，但不同植物中微卫星出现的频率变化是非常大的 常见的二核苷酸重复单位：（AC)n、（GA)n、（AT)n 常见的三核苷酸重复单位： （AAG)n、（AAT)