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?基金项目:国家自然科学基金30770558)
作者简介:马文财,男,黑龙江省哈尔滨人,博士生;主要从事生物信息学、功能基因组学方面的研究。E-mail: wencai_ma@126.com
通信作者:郭政,E-mail: guoz@
基于集成决策树选择癌基因的序列与功能特征
马文财1 王晨光1 郭政1,2 郭鑫武1 王栋1,2 杨达1 顾云燕1 邹金凤1 (1哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 哈尔滨 150086;2电子科技大学生命科学院生物信息学中心 成都 610054)
摘要:目的 根据基因的功能、编码的结构域、序列长度和进化保守性等特征对癌基因的识别能力,研究癌基因相关的特征。方法 通过基于决策树的多分类器集成技术,分析7类特征对癌基因和非癌基因的分类能力。结果 选择出了一组可以有效鉴别癌基因的特征及配对出现的特征组合。结论 根据这些特征以及特征之间的配对模式,能够解释某些癌基因的致癌途径,从而有助于对癌症机制的研究。
关键词:癌基因;特征选择;决策树;基因功能
中图分类号:Q-31 文献标识码:A
Selecting sequence and function features of cancer genes by ensemble decision trees
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