生物信息学在基因芯片中高效应用.pptVIP

第五章、生物信息学与基因芯片 生物信息学和基因芯片是生命科学研究领域中的两种新方法和新技术，生物信息学与基因芯片密切相关，生物信息学促进了基因芯片的研究与应用，而基因芯片则丰富了生物信息学的研究内容。 第一节 概述 １、基因芯片简介 （１）基因芯片的基本原理及生物信息学的作用 基因芯片（genechip），又称DNA微阵列（microarray），把大量已知DNA或寡核苷酸探针密集排列形成的探针阵列，并将经过标记的若干靶核酸序列（样品）通过与芯片特定位置上的探针杂交，便可根 据碱基互补匹配的原理确 定样本的基因序列、基因 表达信息等。 根据探针的类型和长度，基因芯片可分为两类。 其中一类是较长的DNA探针（?100mer）芯片 这类芯片的探针往往是PCR的产物，通过点样方法将探针固定在芯片上，主要用于RNA的表达分析。 另一类是短的寡核苷酸探针芯片 其探针长度为25 mer左右，一般通过在片（原位）合成方法得到，这类芯片既可用于RNA的表达监控，也可以用于核酸序列分析。 载体材料要求： ①载体表面必须具有可以进行化学反应的活性基团，以便与生物分子进行偶联。 ②使单位载体上结合的生物分子达到最佳容量。 ③载体应当是惰性的和有足够的稳定性，包括机械的、物理的和化学的稳定性。 惰性:是指载体的其他性能或特异性吸附都不应该干扰生物分子的功