中国被子植物属的序列初步统计结果.pptVIP

D.应用一键式运算，数据转入后台计算，等算好了，建议最好用邮件通 知用户。 E.应用一键式运算，点击结果出现的画面,界面不太友好。 F. 一键式运算出错。树文件无法显示也无法下载并显示错误。 G、通过软件计算得到的树文件上传至平台后无法显示结果。 7.Visulization 树图不够美观，能否实现手动调节树的分支长短等功能，因为旁边的X-，X+，Y-，Y+并不能满足此要求。 Show internal data后，出现小数，后面的位数太多。 8.Introductory Tutorial A.点击DarwinTree(V1.3)-User Handbook 的“Download” 出现下图结果。 B.说明书要易读。 不要出现类似DarwinTree-PALPP(V1.1)用户入门 中的这种说明。仅仅红色线条标注，没有文字说明。 建议推出一个依据功能完善的新版本，有文字和标注并茂的平台使用手册（DarwinTree-PALPP(V1.0)用户使用手册-用户分析部分，详细；DarwinTree-PALPP(V1.1)用户案例001，简洁）。 C. Review 和Download可以去掉，点击说明书标题即可浏览说明书。 突出显示现在使用版本的说明书，以前版本可以隐藏显示。 9.Documentation 点击Preview时出错 10. ?? Message Board 点击任一项内容，不显示链接内容，而是退出该页面回到主页，需重新登录。 达尔文树—分子数据分析应用平台 报告人：苏俊霞 单 位：中国科学院植物研究所 中国被子植物属的序列初步统计结果 中国被子植物属名录的录入和校对工作中存在的问题 新版平台使用中尚存在的问题 一、中国被子植物属的序列初步统计结果 ⒈被子植物属的各基因序列统计情况图 被子植物属总数：4348-12(+?)-12（is not genus）=4324 ⒉被子植物属的各基因序列统计名录 1.四基因均无序列的中国被子植物属名录 　　（科下无序列属的统计） 2.四基因均有序列的中国被子植物属名录 3.无rbcL基因序列的中国被子植物属名录 ⒊序列统计中可能存在的问题 部分基因统计不全，如18S rDNA、matK，可能由于基因注释不太精确。 名录中的一些格式可能会影响搜索结果（如属名后面有空格则搜不到序列，是否还有其它格式影响）。 异名 二、中国被子植物属名录的录入和校对工作中 存在的问题 1.完成中国被子植物属的名录输入 属名源于《种子植物分布区类型及其起源分化》。 科名采用APG系统的名称，按照APGⅢ对科进行排列。（部分属按照最新的研究成果变动了位置） 名录中包含被子植物4348属。 中国被子植物属的名录 2.校对依据 NCBI名录 中国植物志: 数据库（覃海宁组提供）或中国数字植物标本馆---中国植物志中查询。 APG:/MOBOT/Research/APweb/ Flora of China：中国数字植物标本馆--- Flora of China中查询 ⒊.校对存在问题 为保证搜到NCBI中全部已有序列，下一步工作需要在NCBI搜序列时加入异名列。 如何确定通用的、正确的属名？ （正名和异名在各参考依据种均能搜索到） 0 0 三、新版平台使用中尚存在的问题 1. 页面 A.建议点击Logo可以直接进入主页 B.鼠标放置处，出现乱码。不知道是么原因，是否解决？ 2.View Data Capparaceae[1].xls A.当搜索某个科的序列时，除NCBI版本结果显示正确之外，其余版本，输出的Excel信息不正确，不是该科的信息。 Land_plant.xls Embryophyta[1].xls B.peer-Know 无论选择哪个版本，peer-Know（查询某科没有序列的属）时结果均一致（右图）。 C.View data时，为了快速找到自己需要的信息，是否仅显示有序列的物种或属。 把没有序列的物种或属进行可选择性隐藏，需要时也可显示。 D.图中两个种的rbcL序列号，下面的是正确的，上面的不是序列号。 E.Capparis hastata的rbcL基因 将Source改为Voucher 不是序列号 F.点击下一个子节点的时候，速度缓慢。 G.在View Data时，到了下面这步，是否可能增加全选和反选，这样比一个一个点击节约时间。 3. Statistics Data A.输入某个类群后，一直得不到结果，显示网页上有错误，如下图。或exce-out时出 错。 B.此页面功能？