湖北神农架大九湖泥炭地泥炭藓共生细菌群落分析.pdfVIP

第 ３３卷　第 １期 第　四　纪　研　究 Ｖｏｌ．３３，　Ｎｏ．１ 　２０１３年 １月 ＱＵＡＴＥＲＮＡＲＹ　ＳＣＩＥＮＣＥＳ Ｊａｎｕａｒｙ，２０１３ ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００１７４１０．２０１３．０１．０９ 文章编号　　１００１－７４１０（２０１３）０１－７９－０９ 湖北神农架大九湖泥炭地泥炭藓共生细菌群落分析 ① ① ① ① ② ② 刘　乔 　王红梅 　龚林锋 　向　兴 　黄咸雨 　秦养民 （ 中国地质大学（武汉）生物地质与环境地质国家重点实验室，武汉　４３００７４； 中国地质大学（武汉）地球科学学院，武汉　４３００７４） ① ② 摘要　　对采自湖北神农架大九湖泥炭地泥炭藓（Ｓｐｈａｇｎｕｍｐａｌｕｓｔｒｅ）样品进行了不同预处理，之后提取微生物基 因组 ＤＮＡ，构建克隆文库进而对泥炭藓共生菌的群落结构进行分析。菌落培养实验和荧光定量 ＰＣＲ结果显示，双 氧水能杀死泥炭藓表面附生的微生物及破坏部分 ＤＮＡ，为研究泥炭藓内共生细菌提供一定的途径。群落组成分析 结果表明双氧水处理后，所获得的细菌克隆文库的群落特征发生了改变，主要表现在细菌种类的减少及各菌门所 占比率的变化上：ＮＴＸ０中酸杆菌门（Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ）和变形杆菌门（Ｐｒｏｔｅａｏｂａｃｔｅｒｉａ）百分比含量分别位居第一和第 二，而经过 双 氧水进行 表 面 除菌后 ＮＴＸ０ｄｅｇｅｒｍｉｎｇ中变形 菌 门 （Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）占了绝 对 优 势；而在 ＮＴＸ２ｄｅｇｅｒｍｉｎｇ中，蓝细菌门（Ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）占绝对主导地位，细菌的群落多样性明显降低，细菌种类减少。系统 发育分析表明与泥炭藓内共生的细菌一方面能适应大九湖泥炭湿地酸性、贫营养的环境，另一方面能为泥炭藓提 供碳源、氮源，从而参与泥炭湿地的元素循环。尤其值得注意的是在内共生菌中发现了 型甲烷氧化菌，证实了甲 Ⅱ 烷氧化菌与泥炭藓的内共生关系，暗示着这类细菌通过自身的代谢进而影响全球碳循环的潜在意义。此外，首次 报道了利用细菌的通用引物扩增出了大量泥炭藓叶绿体的序列，这可能为叶绿体内共生学说提供佐证。 主题词　　泥炭藓　大九湖　共生菌　碳循环 中图分类号　　　Ｐ５９３，Ｑ９４９３　　　　　文献标识码　　Ａ 湿地生态系统是陆地生态系统中的重要组成部 的关注。近年来，人们发现泥炭藓的生长与很多微 分，在全球物质循环及气候变化中发挥着重要作用。 生物有关，这些微生物附生在泥炭藓表面或内共生 泥炭地是湿地生态系统中比较常见的一种类型，占 于泥炭藓内部，并推测这些微生物与泥炭藓的生长 ［１］ 及全球物质循环有关。２００５年通过分子生物学技 全球湿地面积的５０％～７０％ ，占全球陆地面积的 ３％，但其储存的碳量却相当于空气中ＣＯ 中Ｃ含量 术及透射电镜等显微技术，人们在泥炭藓透明细胞 ２ 的一半，在全球碳循环中占有重要地位。植物作为 中发现了内共生的甲烷氧化菌［５］，并且发现泥炭地 泥炭地的主要组成部分，其生长状况直接影响泥炭 产生的甲烷气体很大一部分被这些与泥炭藓内共生 地对全球碳循环的贡献。通过水化学测试，可将泥 的甲烷氧化菌所氧化，而甲烷氧化产生的 ＣＯ 又能 ２ 炭地按其营养状况分为富营养、中营养和贫营养 ３ ［６］