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細菌:異常球菌和革蘭氏陰性非變形桿菌 大綱 21.1 產液菌門和栖熱袍菌門 21.2 異常球菌一栖熱菌 21.3 光合細菌 21.4 浮黴狀菌門 21.5 衣原體門 21.6 螺旋體門 21.7 擬桿菌門 產液菌門和栖熱袍菌門 AQUIFICAE AND THERMOTOGAE 產液菌門被認為是最早或最古老的細菌分支 1個綱、1個目和5個屬。研究最多的兩個屬為產液菌屬和氫桿菌屬 嗜火產液菌(Aquifex pyrophilus) 革蘭氏陰性,微好氧桿菌 極端嗜熱菌,最適溫度為85°C,最高生存溫度的95°C 自營型,氧化氫氣、硫代硫酸和硫產生能量 為化學無機自營型菌,暗示其祖先可能是嗜熱菌和化學無機自營菌 第二個最古老或最早分支是栖熱袍菌門 栖熱袍菌屬(Thermotoga ,希臘文therme熱;toga對袍) 極端嗜熱菌,最適生長溫度的80°C ,最高生長溫度90°C 革蘭氏陰性菌,外面有一 鞘狀套 栖熱袍菌屬為化學異營性,有糖解路徑 在碳氫化合物和蛋白消化物進行厭氧生長 基因體已被定序 約為大腸桿菌基因體(460萬bp, base pair)的1/3 產液菌無法在一般有機物上生長,如糖和胺基酸 栖熱袍菌基因體較大,有糖降解基因 基因體約24%的編碼序列與古生菌基因相似(產液菌 16%類似 與古生菌較類似,也許是基因水平轉移所致 異常球菌一栖熱菌 DEINOCOCCUS-THERMUS 異常球菌為球形或桿狀,常成對或成四聯球菌 為好氧性、嗜溫,過氧化氫酶陽性,能利用幾種糖產酸 可被染為革蘭氏陽性 細胞壁分層並有革蘭氏陰性菌類似之外膜 缺少磷壁酸,有質膜和大量的棕櫚酸而非磷脂甘油磷脂 對乾燥和輻射均有很強抗性,它們能在300萬- 500萬rad的輻射下存活(暴露在100 rad輻射下可使人致死) 可由絞肉、糞便、空氣、淡水和其他來源中 分離,但天然生存環境則尚不清楚 對乾燥和輻射的強大抗性原因 具有修復受嚴重損壞染色體的能力 其基因體包含兩個環狀染色體、一個巨大質體和一個小質體 染色體會被分解成許多片斷,在12 - 24小時內,它們會將碎片拼接在一起 主要是具有極高效的Rec A蛋白質 其染色體有非常結實似環構造 此菌具有一較多的DNA修復機制(20 Mut gene)和許多重複序列 光合細菌 PHOTOSYNTHETIC BACTERIA 有三個類群:紫細菌(紫硫菌、紫色非硫菌)、綠細菌(綠硫菌、綠色非硫菌)和藍細菌, 藍細菌可以進行產氧型光合作用 利用水為電子供體產生氧氣 紫細菌和綠細菌則利用不產氧光合作用 不能利用水作為電子來源,而是利用還原分子如硫 化氫、硫、氫氣和有機物作為電子來源生成NADH、NADPH 形成許多硫顆粒 紫硫細菌在其細胞內積聚硫顆粒 而綠硫細菌在細胞外沉積硫顆粒 藍細菌含有葉綠素a、紫細菌和綠細菌含有細菌葉綠素 湖泊和池塘中通常有較厚表層之藍細菌和藻 類,能夠吸收大量的藍光和紅光 紫細菌和綠細菌的細菌葉綠素吸收長波長的遠紅外光 綠屈繞菌門Phylum Chloroflexi 包括光合作用和非光合作用成員 光合綠色非硫細菌的主要代表 呈絲狀,滑行運動和嗜熱性細菌,通常可由中性到鹼性熱泉中分離,通常與藍細菌在一起 此菌沒有與任何細菌類群緊密相關,是細菌樹中一個深入且古老的分支營養類型 綠硫桿菌門Phylum Chlorobi 綠色硫細菌為一小類群,絕對厭氧、光能無機自營型菌 光合色素位於質膜附近 某些種具有氣泡以調節它們在水中的深度 形態富多樣性,有桿狀、球狀或弧形。 有些單個生長,另一些則成鏈狀和成串狀、呈草綠色或巧克力棕色 藍細胞門Phylum Cyanobacteria 是光合細菌中最大也是最多樣化類群 光合作用系統含有葉綠素和光合系統II,且行產氧型光合作用,與真核生物非常相似 沒有一個完整的檸檬酸循 直徑l ~ 10 mm,可為單細胞形成許多形狀的菌落,或形成絲狀結構物 含有藻藍素而呈藍綠色,小部分因含有紅色素藻紅素而呈紅色或棕色 利用多種機制複製:二分裂、出芽、斷裂和複分裂 複分裂-細胞膨大後多次分裂產生許多較小的子體,直到母細胞破裂,才釋出子代 許多絲狀藍細菌可以異形包囊heterocysts之特殊細胞來固定大氣中之氮氣 浮黴狀菌門 PHYLUM PLANCTOMYCETES 出芽細菌缺少做肽聚糖,細胞壁中有顯著的杯形結構或小窩 衣原體門PHYLUM CHLAMYDIAE (披衣菌門) 披衣菌和立克次氏體,革蘭氏陰性類群,絕對胞內寄生 由16S rRNA資料, 第二版把披衣菌置於披衣菌門,而把立克次氏體置於 α-變形桿菌 不比痘病毒大 大小介 於0.2-1.5 μm 只在宿主細胞的細胞質囊中進行繁殖,包括原生小體和網狀體形成的特定發育循環
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