基因定序核心设施.doc

頁 PAGE1 / NUMPAGES3 本表若不敷使用，請自行複製 臺北醫學大學 基因定序核心設施服務申請書 中華民國 年 月 日 使 用 人 資 料 計畫主持人姓名(中文全名)： 計畫主持人e-mail address： 主持人所屬機構及單位： 計畫經費來源*： 計畫編號： 聯絡人姓名： 聯絡人電話： 聯絡人e-mail address： 服務項目及內容 數量 金 額 備註 項次 服務名稱 單價 總計 NT$ 收據 編號 新台幣：(大寫金額) 佰 拾 萬 仟 佰 拾 元整 計畫主持人 核心設施經辦人 備註： 申請書本頁請填寫一式兩份，由申請者及核心設施分別收執留底，申請者繳費後需通知核心設施確認，方能完成申請作業。 樣品的品質須符合送測注意事項中要求，申請者需詳填送測樣品資料表，確認後請在送測樣品注意事項上簽名。 請計畫主持人於發表論文時致謝或提供致謝函，以利統計各設施之效益。 本單據之個人資料僅供服務統計用，敬請完整填寫所有資料。 *計畫經費來源選項：NRPB、國科會、衛生署、經濟部、教育部、中研院、醫院、學校、 其他(如財團法人)或產業界等 送測樣品資料表 樣品編號：___________ 樣品名稱（英文） 樣品物種 Reference Sequence (NCBI GI number) 定序方式 Single End Multiplexing Paired-End Mate Pair 定序長度 50 bp 150 bp 250 bp 定序種類 □ DNA Re Sequencing □ denovo Sequencing □ ChIP Sequencing □ Transcriptome □ Small RNA Sequencing □ Amplicon Sequencing □ Cancer Panel 送件核酸類型 □ Genomic DNA □ ChIP DNA □ total RNA □ PCR amplicons 樣品濃度（ng/μl） 樣品體積（μl） 樣品緩衝液 TE buffer nuclease free water 260/280 ratio 260/230 ratio 分析需求 Basic Advance 電泳圖 (請註明sample以及marker loading量) 送測樣品注意事項 IMPORTANT!! We strongly recommend the use of Qubit (Invitrogen) for sample quantification; Nanodrop can often overestimate the amount of quantity (up to 10+ times) in samples due to artifacts. DNA Sample For genome sequencing, please provide a minimum of 10 micrograms DNA; for mate pair sequencing, please provide a minimum of 50 micrograms DNA. The minimum concentration of is 300 nanograms / microliter. Mail samples resuspend in TE buffer with a cold pack. The QC information listed below must be provided for each sample: 260 / 280 ratio = 1.8 - 2.0, 260 / 230 ratio 1.7 Agarose gel to verify that sample is high molecular weight and no degradation on a 1 % agarose gel. (Please attach image to this documentation) Recommend the method for extraction： For DNA cleanup, use phenol / chloroform extraction followed by ethanol precipitation with several washes. RNAse-treated samples are preferred. RNA Sample For mRNA Sequencing, please provide a minimum of 15 mi