癌旁肺组织基因表达谱与肺鳞癌进展的相关性研究.ppt

癌旁肺组织基因表达谱与肺鳞癌进展的相关性研究 曹邦荣，冯林，刘宇，高燕宁，张开泰，程书钧 北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所，病因及癌变研究室，北京100021 研究背景 慢性炎症与肿瘤 癌旁组织广泛存在炎症反应。 炎症反应诱发局部DNA损伤，诱导EMT，诱导血管生成。 慢性炎症与肝癌，胃癌，结直肠癌，肺癌的发生具有重要关系。 癌旁组织与某些肿瘤的预后相关 肝癌癌旁组织的基因表达谱肝癌预后相关（ Budhu et al.，2006）。 肺腺癌癌旁组织中15个细胞因子的表达谱与肺腺癌转移相关（ Seike et al.，2007）。 样本 15例非癌症病人外周肺组织。 60例原发性肺鳞癌病人癌旁肺组织。 技术手段 Agilent 4×44k 基因表达谱芯片分析。 基于表达谱的基因网络分析。 现有Pathway的GSEA分析。 样本 15例非癌症病人外周肺组织。 60例原发性肺鳞癌病人癌旁肺组织。 技术手段 Agilent 4×44k 基因表达谱芯片分析。 基于表达谱的基因网络分析。 现有Pathway的GSEA分析。 癌旁肺组织与非癌症病人肺组织基因表达谱差异分析 肺鳞癌癌旁组织中基因共表达网络分析 针对Pathway的GSEA分析 癌旁肺组织与非癌症病人肺组织基因表达谱差异分析 肺鳞癌癌旁组织中基因共表达网络分析 表达数据预处理 标准化。 同一个基因选取表达均值最大的