非智慧性设计unintelligentdesign.doc

仿病毒—生命的非智慧性設計起源？(unintelligent design) 地球上很少有東西比病毒更怪異，就外觀來說，他們是由蛋白質所包覆的DNA或RNA分子，他們並不像細胞ㄧ般具有細胞膜，他們根本不算細胞。只有再侵入活體細胞並佔有其代謝機制時，他們才像具有生命的。他們侵略活體細胞的效率之高使的他們令人畏懼，如伊波拉和愛滋病毒，他們不怕抗生素，因為事實上，他們並不真正具有生命。 病毒的發現要追朔到一世紀以前，俄國生物學家伊凡諾斯基以患病的煙草葉片作實驗，先將葉汁以細瓷濾器過濾，再將濾液塗抹在健康的葉片上，卻赫然發現健康的葉片不久也出現病徵，足見濾液中含有比當時所知都更小的致病菌，當時稱之為濾過性毒，直到1935年發明了電子顯微鏡才揭發這個物質的真面目，這個物質也就是現今的煙草馬賽克鑲嵌病毒（tobaco mosaic virus）。 我們一直在修正對病毒的定義，但即便最嚴苛標準有時也不太適用。多數的生物學家普遍認同生物三域（Three Domains）說，即真核生物（細胞有核）、真細菌（無核單細胞生物）、古細菌，病毒獨立於三域，被視為演化的上的後來者，好比是被當作生命往更複雜有機體裝配組裝時所掉落的遺傳片段。然而最近卻興起了ㄧ股新的理論，目前科學家已分化4000種分屬不同科的病毒，然而這只是地球上所有病毒的小片段一小部分。定序人類基因組的遺傳學者J.Craig Venter，在全球取得海水樣本，並發現數百萬種新病毒，此舉更使得目前已知基因增加10倍。根據科學家估計，我們文獻中只記載了這個星球上不到百分之1的生物，相較於這剩下的百分之99未明的物種中，科學家估計有10倍以上未知的病毒量存在著會是這個值至少10倍。由此可知，世上壓倒是性多數的病毒不但對生命無害甚至整合於其中。 現在，隨著一個重要病毒的發現，科學家將重新思索如何定義這群特殊的生命體。這個新發現的病毒，稱為仿病毒(mimivirus 因他近似細菌)，他詭異的程度，使得符合在三域說的生命樹外，可以另外形生成一個界域，因為仿病毒的遺傳復雜性高於已知的任何一種病毒，甚至高於某部份的細菌。這說明某些病毒具有構造更複雜祖先，現在科學家更由仿病毒找到和其他各物種ㄧ樣古老的證據，而且這種病毒更參與了演化生命的誕生。 這個發現徹底顛覆生命起緣的想法，病毒向來被視為生物的投機客，現今竟成了生命形成的助力。就我們以往熟知的生命起源故事，為簡單初始物質彼此結合形產生複雜生命體，如今病毒也衍伸出ㄧ套生命起源論：一大群無自我意識的微觀複製機制，在複製時產生的遺傳錯誤累積，這些莽撞的意外，便是生命的起源，更證實了生命起源是復雜混亂，且很顯然是非智慧性的設計。由仿病毒的發現，科學家終於能夠對病毒下新的註解，也就是病毒生命的主要推動者。 2003年，ㄧ位細菌學家發現在ㄧ個1992年於英國Bradford一個水冷塔中抽取的樣本中發現他認為是好像有一株新種的Legionella菌，但透過顯微鏡他發現這個菌的六角結構使他的立體構造近似ㄧ顆足球，這是典型的病毒立體特徵，最後被發表為仿病毒 。除了它獨特的外型，這個病毒可以表現ㄧ種特殊階段「蝕態」。，也就是他能穿透細胞，消失在核中，使細胞看似ㄧ切正常，然後細胞被控制製造病毒分子最後破裂而亡。然而這個病毒驚人之處可不止於此，他的基因組可以多達120萬個字母，是其他大型病毒的3倍之多，此外在這巨大的基因組上，可以找到能編碼轉譯蛋白、DNA修補脢和其他蛋白的基因，這些功能原本認為只會出現在複雜的細胞生物當中，且可和細菌基因重復達1000個基因。病毒和複雜細菌的界線似乎漸漸模糊。 在發現仿病毒後，許多過去對病毒的定義都不適用，拿仿病毒的DNA和其他三域也就是（真核生物、真細菌、古細菌）的DNA做比較，可發現仿病毒獨樹ㄧ格，且比DNA病毒品系更加古老。另外仿病毒編碼其足球型外殼的基因，被保留到能感染三域生物的病毒基因中，這點指出仿病毒或和仿病毒相似的病毒，出現在三域生物之前，在行成複雜生命個體扮演重要角色，就像祖先一樣，病毒在三域之前扮演創造人類及所有複雜的生物的重要角色。 病毒為生命起源的祖先是個令人難以接受的觀念，寄生物質對我們來說只是外來的物種，必須要依賴我們而生存，所以寄生物質為生命起源這觀念很難被接受，但是小個體不一定沒牽涉到演化的過程，仿病毒mimiviruse特大的基因組成讓它們接近一個獨立的個體，根據科學家的假設，仿病毒mimiviruse在之前演化已除去可自我複製的基因，仿病毒mimiviruse的祖先與現代所形成的生物有關連，仿病毒mimiviruse就像是一個連結以前與現在的連結。 透過基因序列技術的幫助，科學家分析了三界或四界生物的基因序列並互相對照比