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分枝杆菌数据库介绍 分枝杆菌数据库介绍 TB Database: An integrated platform for tuberculosis research / TubercuList: Mycobacterium tuberculosis database http://tuberculist.epfl.ch/ SmegmaList: Mycobacterium smegmatis database http://mycobrowser.epfl.ch/smegmalist.html TubercuList Web Server: A database dedicated to the analysis of the genomes of the tubercle bacilli http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/ /jpkc/fjgc 分枝杆菌数据库介绍 MtbRegList?: A database dedicated to the analysis of gene expression?and regulation data in?Mycobacterium tuberculosis.?It is designed to contain most of the characterized?transcription start sites and DNA binding sites cross-referenced with their respective transcription factor,?along with some predicted regulatory motifs. http://pages.usherbrooke.ca/gaudreau/MtbRegList/www/index.php Web TB: A resource for?Mycobacterium tuberculosis?researchers / 蛋白质组与代谢组实验室 / 分枝杆菌数据库介绍 TubercuList and SmegmaList TubercuList and SmegmaList 快速浏览基因/蛋白的基本信息 TubercuList: Mycobacterium tuberculosis database http://tuberculist.epfl.ch/ SmegmaList: Mycobacterium smegmatis database http://mycobrowser.epfl.ch/smegmalist.html 转录调控因子 例1：已知SigL的识别motif，TGAACC.n16.CGTGTC，在基因组中寻找其靶标 http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/ 例1：已知基因号（Rv1876），探究该基因是否受转录调控因子、Sigma因子、RR的调控 http://pages.usherbrooke.ca/gaudreau/MtbRegList/www/genome_search.php Functional category 根据基因（蛋白）的功能聚类 http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/ http://pages.usherbrooke.ca/gaudreau/MtbRegList/www/genome_search.php MtbRegList and TubercuList Web Server http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/ http://pages.usherbrooke.ca/gaudreau/MtbRegList/www/index.php TB Database / 查看大部分组学文献 查看大部分研究基因功能的文献 基因聚类分析 不同突变株或实验条件下基因表达数据 TB Database TB Database Genomes: 分枝杆菌不同菌株的基本信息，包括基因组大小、生长条件、致病性等。 Genes: Pfam, Rfam, Operons, Blast… Feature search: TB Database-Genomic data TB Database-Genomic data TB Database-Systems Biology TB Database-Genomic Data Comparative Analysis：