理论课20眼科实验室检查演示文稿.ppt

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3、常用PCR反应条件 高温变性/预变性( 92℃~95 ℃ ) 低温复性( 55℃~65 ℃ ) 中温延伸( 72 ℃ ) * 4、PCR反应特点  特异性强、灵敏度高、简便、快速、对标本的纯度要求低  PCR反应的特异性决定因素为:   ①引物与模板DNA特异正确的结合;   ②碱基配对原则;   ③Taq DNA聚合酶合成反应的忠实性;   ④靶基因的特异性与保守性。 * 5、结果判断 取扩增产物10ul于2%琼脂糖(内含溴乙锭)凝胶上进行电泳30min,在紫外透射反射仪上观察结果,阳性者在特定位置出现橙黄色条带,阴性者在相应位置无条带。 * 6、应用举例 沙眼衣原体(沙眼病) 疱疹病毒(角膜感染) 地中海贫血基因检测 * 地中海贫血基因检测 引物 C1 5′-GTACGGCTGTCATCACTTAGACCTCA-3′ C2 5′-TGCAGCTTGTCACAGTGCAGCTCACT-3′ C3 5′-GTGTACACATATTGACCAAA-3′ C4 5′-AGCACACAGACCAGCACGTT-3′ 引物由上海生工生物工程有限公司合成 * 地中海贫血基因检测 * PCR反应体系,总共25μl,具体如下 10×buffer缓冲液 2.5μl DNA模板 5.0μl dNTP (2.5m mol/L) 2.5μl Mg2+ (25m mol/L) 1.7μl 引物(包含上下游引物) (20μmol/L) 0.5μl 双蒸水 12.0μl DNA聚合酶(Taq酶) 0.8μl (1U/UL) ―――――――――――――――――――――――――― 25.0μl 扩增条件: 94℃预变性5min,然后93℃ 35s,55℃ 35s,70℃ 50s,共35个循环,最后置72℃延伸10min 。 地中海贫血基因检测 * 423bp 602bp 1503bp C1/2 PCR产物电泳图 C3/4 7、PCR反应影响因素 PCR反应的关键环节有 ①模板核酸的制备, ②引物的质量与特异性, ③酶的质量及, ④PCR循环条件。 反应五要素 引物、酶、dNTP、模板和Mg2+ * (二)实时荧光定量PCR * * TaqMan技术原理示意图 3’端的荧光Q分子吸收5’端荧光R分子的荧光信号 探针5’端连接的荧光R分子被Taq酶切割下来 荧光R分子发出荧光,切割的荧光分子数与PCR数量成比例 5’ 3’ 5’ 3’ Q R Q 5’ 3’ R 5’ 3’ 激发 5’ 3’ 5’ 3’ 激发 R Q 引物 Taq 酶 应用 多用于检测特定已知基因在生理或病理条件下的表达情况,如: 突眼病——外周血淋巴细胞中α-糖皮质激素受体与β-糖皮质激素受体的表达情况以及两者之间的比例关系,以指导是否采用糖皮质激素治疗。 * 应用 利用实时荧光定量PCR检测糖尿病大鼠视网膜中转化生长因子β受体-1和受体-2基因表达: 定量检测转化生长因子β受体-1(TβR 1)和转化生长因子β受体-2(TβR 2 )编码基因在糖尿病大鼠视网膜中不同时相点的动态表达水平,以探讨转化生长因子β及转化生长因子β受体在糖尿病视网膜病变(DR)中的作用。 * 三、核酸凝胶电泳技术 核酸(DNA或RNA)在碱性缓冲液中带负电荷,向阳极移动,在一定电场强度下,迁移率与其分子量成线性关系。 指示剂 琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳 * 不同浓度PAG分离DNA片段的范围 PAG浓度(%) 分离DNA片段 溴酚蓝指示剂的迁移率 (相当于相应bp数的DNA) 3.5 100-1000 100 5.0 100-500 65 8.0 60-400 40 12.0 50-200 20 20.0 5-100 12 * 四、基因突变分析技术 已知点突变的检测 1.PCR结合限制性内切酶酶切片长度多态性分析(PCR

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