化学具体结构表示和可视化.ppt

第十一章 化学结构的表示与可视化 西安理工大学 刘广钧 第十一章 化学结构的表示与可视化 化学结构即广义的分子结构与化学反应过程，包括：静态的分子与超分子结构、高分子与生物大分子结构、分子聚集态和晶体结构；化学反应过程与过渡态。 对化学结构数值表示的研究随着化学信息计算机处理的需求而迅速发展起来。本章不包括化学反应信息表示和处理的相关内容。 第十一章 化学结构的表示与可视化 分子结构指分子的拓扑结构和几何结构。 考虑化学拓扑结构信息主要是由于以下几方面的原因：对数百万种已知化合物结构信息用计算机进行标引、存储、检索和管理；关联化学结构与化合物性质,用作分子设计的结构参数；合成路线的最优设计；药物设计领域用于生物大分子与药物分子在三维局域结构匹配检索；进行辅助结构自动解析。 第十一章 化学结构的表示与可视化 分子拓扑结构表示有：线性表达式、矩阵指数和图形表示。 化学中常用的有机分子结构式是有机分子拓扑结构的图形表示。基因中核酸的排列（连接）顺序和蛋白质的一级结构也是拓扑结构。 2000年世界重大科技事件之一的“人类基因组计划”就是测定一位白人青年男子的基因中核酸的排列顺序。 第十一章 化学结构的表示与可视化 化学信息、分子拓扑结构信息的图形表示（有机分子结构的二维与三维表示以及有机反应的计算机表示方法）是计算机图形学在化学信息领域的重要应用，是现代化学结构信息存储与检索和化学反应分