第三章克隆载体特征和类型.pptVIP

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第三章 基因克隆的载体 载体:携带外源DNA进入宿主细胞的工具。 能够运载外源DNA片段(目的基因)进入受体细胞,具有自我复制能力,使外源DNA片段在受体细胞中得到扩增和表达,不被受体细胞的酶系统所破坏的一类DNA分子。 野生型入噬菌体DNA为双链线性分子 黏性末端(cohesive end):线性分子左右两端各有12bp组成的5端突出的粘性末端,?DNA进入宿主细胞后黏性末端连接形成环DNA分子。 cos位点(cohesive end site) :指在连接酶的作用下,连接上述黏性末端结合形成的双链DNA区段。又称黏性末端位点。 l噬菌体DNA分子上有56种限制性核酸内切酶识别位点。 温和噬菌体,易于在溶源生长保存,在溶菌生长增殖。 C 用于基因转移的受体菌或细胞 考斯质粒与噬菌粒 考斯质粒(cosmid) 考斯质粒载体的特点: 能像l-DNA那样进行体外包装,并高效转染受体细胞 装载量大(45 kb)且克隆片段具有一定的大小范围 能像质粒那样在受体细胞中自主复制 重组操作简便,筛选容易 不能体内包装,不裂解受体细胞 考斯质粒与噬菌粒 噬菌粒(phagemid or phasmid) 噬菌粒载体的特点: 噬菌粒是一类人工构建的含有单链噬菌体包装序列、复制子 以及质粒复制子、克隆位点、标记基因的特殊类型的载体 能像M13-DNA那样体外包装,并高效转染受体细胞 装载量比常规的M13mp系列要大很多(10 kb) 能像质粒那样在受体细胞中自主复制 重组操作简便,筛选容易 通过克隆双链DNA能获得同等长度的单一单链DNA 考斯质粒与噬菌粒 噬菌粒(phagemid or phasmid) 重要的噬菌粒载体:pUC118 / 119 pUC118 pUC18 + M13间隔区 IG pUC119 pUC19 + M13间隔区 IG 500 个拷贝 3200 bp MCS lacZ’ lacI ori Apr M13-MG pUC118 / 119 表示M13辅助噬菌体DNA 考斯质粒与噬菌粒 噬菌粒(phagemid or phasmid) 重要的噬菌粒载体:pBluescript 体外转录载体 pBluescript = pUC + f1-ori + PT3 + PT7 2958 bp MCS lacZ’ PT7 ori Apr f1-ori pBluescript PT3 噬菌体启动子PT3和PT7强化外 源基因的转录 提取出来的单链DNA重组分子 在噬菌体RNA聚合酶的存 在下,又可实现外源基因 的体外转录 人造染色体载体 人类、动物、植物的全基因组序列分析往往需要克隆数百 甚至上千 kb 的DNA片段, 此时考斯质粒和噬菌粒载体的装载 量也远远不能满足需要。 将细菌接合因子或酵母菌染色体上的复制区、分配区、稳 定区与质粒组装在一起,即可构成染色体载体。当大片段的外 源DNA克隆在这些染色体载体上后,便形成重组人造染色体, 它能像天然染色体那样,在受体细胞中稳定的复制并遗传。 目前常用的人造染色体载体包括: 细菌人造染色体(BAC) 酵母人造染色体(YAC) 人造染色体载体 细菌人造染色体(Bacterial Artificial Chromosomes BAC) 细菌人造染色体通常是在大肠杆菌性因子F质粒的基础上 构建的,其装载量范围在50 - 300 kb之间 各种类型的pBACs在大肠杆菌受体菌只能维持单一拷贝 pBACs主要适用于: 克隆大型基因簇(gene cluster)结构 构建动植物基因文库 人造染色体载体 酵母人造染色体(Yeast Artificial Chromosomes YAC) YAC载体应含有下列元件: 酵母染色体的端粒序列 酵母人造染色体的构建: pYAC4 CEN4 EcoRI URA3 TEL BamHI TEL ori Apr TRP1 ARS1 酵母染色体的复制子 酵母染色体的中心粒序列 酵母系统的选择标记 大肠杆菌的复制子 大肠杆菌的选择标记 YAC载体的装载量为350 - 400 kb 人造染色体载体 酵母人造染色体(Yeast Artificial Chromosomes YAC) 酵母人造染色体的使用: pYAC4 CEN EcoRI URA TEL BamHI TEL ori Apr TRP ARS EcoRI EcoRI EcoRI BamHI 连接 转化酵母菌 重组酵母染色体 3 基因工程的基本条件 各种基因工程受体的特性 实验室常用的基因工程受体 受体细胞应具备的条件 受体细胞应具备的条件 限制性缺陷型 外切酶和内切酶活性缺陷(recB-,recC-,hsdR-) 重组整合缺陷型 用于

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