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表观遗传学;提纲;;;Calico cat;表观遗传：指在没有DNA序列变化的基础上，基因表达和调控状态的可遗传性改变。 表观遗传学：研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传性变化的科学。 特征：可遗传；可逆性；DNA不变;表观遗传学 vs 遗传学;对遗传的影响;对进化的影响;表观遗传学的发展史;表观遗传学内容;Epigenetics:DNA Methylation;什么是DNA甲基化 ? 动态变化/可逆性;DNA如何被甲基化？;基因哪个区域易被甲基化?;表观遗传修饰的重编程： 甲基化与去甲基化;methyl-CpG-binding protein MeCP2 MeCP2-KO neurological defects Rett syndrome in humans MBD1 no obvious phenotype MBD2 high affinity to mCpG NuRD (mi-2) co-repressor MBD3 no affinity to mCpG NuRD co-repressor, emb lethal MBD4 DNA repair T:G mismatch glycosylase MBD-KO high CpG mutation Kaiso zinc-finger protein;为什么基因组需要甲基化 ？;表观遗传与发育;DNA甲基化的检测;Sanger-seq;非BS-转换法;Epigenetics:Histone Modification ;核小体是组成染色质的基本结构单位 高度有序的组装和折叠： 长度由2m变成小于10μm 直径由2nm变成1400nm ;组蛋白及变异体;组蛋白的多种修饰及功能;组蛋白修饰的主要酶;促使核小体重排的三种方式;Epigenetics:Chromatin Conformation;染色质重塑（chromatin remodeling）：就是异染色质和常染色质状态的转换。包括组蛋白修饰、DNA甲基化和ATP依赖的染色质重塑复合物改变核小体位置和染色质结构使特定区域DNA暴露或封闭的过程;ATP-依赖的染色质重塑;组蛋白修饰与DNA甲基化相互作用 调控基因的转录活性;染色体构象检测;Epigenetics:Non-coding RNA ;非编码RNA（ncRNA）是指不能被翻译为蛋白或多肽的功能RNA 持家非编码RNA rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA。 调控非编码RNA 长度大于200个核苷酸的长链非编码RNA（lncRNA） 长度小于200个核苷酸的短链ncRNA miRNA siRNA piRNA;（一）miRNA;（二）lncRNA;Epigenetics:Allelic imbalance in gene expression;;不平衡表达;遗传印记基因;印记控制区调控印记;基于绝缘子的印记机制; ;;;Epigenetics:X-Chromosome Inactivation;性染色体：剂量补偿效应（Lyon假说）;X染色体失活：Lyonization; X染色体失活中心（X-Inactivation Center，XIC）是X染??体上负责保证只有一条X染色体处于活性状态的区域。 XIC为X染色体上长约100-500kb的片段，包括XIST、TSIX、JPX、FTX、CHIC1等基因片段，其转录产物的长非编码RNA（Long no coding RNA, LncRNA）可相互作用并调控X染色体失活。 染色体失活从X染色体上的XIC开始并向两侧延伸，直至染色体的末端。 X染色体失活受XIC上编码的多个基因共同调控。;X染色体失活周期