高通量测序培训课程-常见NGS方案实验流程及常见问题解析-讲义.pptx

常见NGS方案实验流程及问题解析概要常见NGS方案实验原理及流程介绍常见问题解析Hiseq测序仪相关知识及指标概要常见NGS方案实验原理及流程介绍常见问题解析Hiseq测序仪相关知识及指标基因组学研究基因组重测序未知基因组测序单细胞基因组测序表观遗传学研究全基因组甲基化测序MeDIP-Seq简化甲基化测序DNA测序靶向区域研究全外显子组测序靶向捕获测序扩增子测序免疫组学研究ChIP-SeqDNA文库转录组学研究mRNA-Seq全转录组测序单细胞转录组组测序转录因子研究RIP-SeqcDNA测序转录表达调控研究sRNA-SeqNGS基本流程STEP1样本前处理STEP2文库构建STEP3上机测序STEP4生物信息分析样本前处理样本前处理都做些什么？核酸提取（DNA/RNA)样本类型有哪些？人，动物的血液及器官组织等。植物（根茎叶，胚芽，种子等）。微生物（细菌，真菌）。DNA提取萃取沉淀DNA提取的基本原理DNA溶于水，在钠盐比在水中的溶解度较大。但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有机溶剂。 DNA在生物体中的存在形式DNA在细胞中常以核酸—蛋白复合体（核蛋白）形式存在。 DNA提取基本流程细胞破碎杂质去除沉淀DNA溶解DNADNA提取总原则保证核酸一级结构的完整性； 排除其它分子的污染。 DNA提取方法概述人，动物组织（SDS法）人，动物全血，体液等（离心柱法）植物组织提取（CTAB法）