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实验七 蛋白质结构与功能预测 一、实验目的 了解蛋白结构与功能的常用网站和软件； 学会蛋白质结构和功能预测的方法。 二、实验内容和方法 蛋白质基本理化性质分析 利用Protparam 工具 expasy.org/tools/protparam.html预测蛋白的基本理化性质： 相对分子质量 氨基酸组成 等电点（PI） 消光系数 半衰期 不稳定系数 总平均亲水性 …… 2. 利用TMHMM-cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0进行跨膜域分析 Chicken stard3nl protein transmembrane 3. 信号肽预测 SignalP 4.1 Server cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 4.蛋白质二级结构预测 SOPMA -npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html 5.蛋白质三维结构预测 SWISS-MODEL工具 expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html 同源建模方法 与PDB数据库已知结构的蛋白质序列比对进行预测 主要参数/选项 输出结果 作业 从NCBI网站下载任意氨基酸序列，预测其理化性质、跨膜域、信号肽、二级结构、三级结构。抓图黏贴到实验报告中