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fMRI实验设计及数据处理 组块设计（block design) 时间相关设计（event-related design) 混合设计（hybrid design） 一 实验设计 Concepts: Trial 2 Block 实验设计— 组块设计 + + + + + 画线 画线 画线 画线 Block design 的特点及注意事项 具有较好的detection power 比较简单，容易统计 从某任务当前block开始到下一次该任务block开始的时间间隔最好不要超过128秒（high-passed filter） 刺激间间隔小的话block效应越高 在一定范围内Block内的trial数越多越好，但研究表明block时间不宜超过60秒 实验设计—组块设计 慢速事件相关实验设计： 快速时间相关实验设计： 实验设计—事件相关实验设计 事件相关设计特点及注意事项： 1 能分离事件，处理更灵活 2刺激间间隔越随机化（加jitter或null trial)越好 3 快速事件相关实验设计中，单个条件最好有40个trial左右 实验设计—事件相关实验设计 特点及注意事项： 1 能分离持续性神经活动（block）和短暂性神经活动（event) 2 处理和设计起来比较复杂，需要权衡的东西较多 3 要保证block和event的相关性不高 实验设计—混合实验设计 打开spm 点击右下角 dicom import，转换成spm格式的图。 Overview 1 预处理（preprocess） Slice timing Motion correction Normalization Smooth 数据分析 Individual analysis Group analysis 二 数据处理 Slice timing： block设计可以不做这步 event设计中如采用间隔扫描，先做slice timing再做头动矫正；如采用序列扫描，则先做头动矫正再做slice timing 输入参数： 【DATA】：输入数据（所有fr开头的数据） 【num berof slice】:每个scan的层数 【TA】：TR-(TR/层数) 【SLICE ORDER】:扫描顺序 例如隔扫，输入：“[1:2:层数 2:2:层数]” 【reference】：参考层（可以是第一层，也可以是中间层） 二 数据处理—预处理 Realignment（头动矫正） 这步一定要做 做完以后会生成6个头动参数，这些参数可以放到后面的model中 输入参数： 选realigment:estimatereslice 【DATA】：选择数据（以a开头的数据） 【RESLICE IMAGES】：SPM MANUAL中设定默认，北师大建议选“MEAN IMAGE ONLY”那项 得到一个rp打头的参数文件。 二 数据处理—预处理 Normalization：空间标准化 三种配准方法： 1 直接把bold图像与EPI模板配 2 个体bold像与结构像模板配（coregister）、结构像与模板配、再把两个结果配准 3 先把个体结构像与bold像配（ coregister ）、对结构像做segmentation、再把bold像与segmentation结果配（SMP8 MANUAL） 二 数据处理—预处理 方法1 直接把bold图像与EPI模板配 1选择“Normalise: Estimate Write” 2选中“data”——“new sbject”，在data下新出现的 “subject” 选项中作如下设置， “source image”选择空间校准步骤中生成的mean文件， “image to write”选择所有刚进行完校准的文件“ra*.img”，“template image”我们选择“EPI.nii”，其余采用默认设置，点绿三角运行。 生成w开头文件 方法2： 1 coregister: estimate 【reference】:结构像 【source】:mean文件 【other images】：选其他r开头头动后的结果 normalize: estimatewrite 【DATA】:new subject 【source image】:结构像 【IMAGE TO WRITE】：结构像 【 TEMPLATE IMGE】：选