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Y染色体微缺失检测试剂盒颜色补偿实验操作说明
(适用于Roche Lightcycler 480机型)
【反应液配制】
如下表所示,按照管号1-5分别配制5份不同的反应液,每份反应液配6个平行管。
每个反应管含有22.8 μL的反应预混液,0.2 μL Taq酶(管号6)以及2 μL阳性对照品(管号7)。如反应于96孔板中进行,请按下图所示进行反应液的板位分布排列。
(注:平行管反应液应统一配置后,再分装为6管,每管25 μL)
反应液
内容物
反应板位
反应液1
空白预混液(管号1)+Taq酶+阳性对照
B2-G2
反应液2
FAM预混液(管号2)+Taq酶+阳性对照
B4-G4
反应液3
HEX预混液(管号3)+Taq酶+阳性对照
B6-G6
反应液4
ROX预混液(管号4)+Taq酶+阳性对照
B8-G8
反应液5
CY5预混液(管号5)+Taq酶+阳性对照
B10-G10
反应液3反应液2反应液
反应液3
反应液2
反应液1
反应液4
反应液5
【软件设置】
打开主界面,在右侧工具栏中选择“open tools”。打开后,在页面中选择“Detection Formats”,新建一个程序,并命名,如“YDEL”,然后在“Filter Cominarion Selection”中设置所需要的荧光通道波长,并保存,如下图所示:
2、回到主界面,在右侧工具栏中选择“New Experiment”,新建一个实验,在“Detection Formats”菜单中,选择上一步所设检测模式,如“YDEL”;然后,点击右侧“Cutomize”,如下图所示:
SHAPE
3、点击“Cutomize”后,打开以下界面,选择“Dynamic”,确认4个荧光通道全部打“√”,并保存,如下图:
4、将配制好的样本按要求放入第2、4、6、8、10排,分别对应不同的荧光通道,如下图所示:
反应液
反应液3
反应液2
反应液1
反应液4
反应液5
5、放置样本后,进行实验程序设置,如下表和图所示:
体系
总体积为 25 微升(μl)
分析模式
核酸扩增
反应
阶段
条件
循环数
预变性
95℃; 3分钟(min)
1
PCR
95℃; 15秒(sec)
40
Quantification
61℃; 20秒(sec)采集
72℃; 20秒(sec)
熔解曲线分析
变性
95℃; 1秒(sec)
1
复性
40℃; 30秒(sec)
1
熔解曲线分析
40℃ 升温至66℃;
升温速率 0.03℃/秒;
荧光采集次数5 次/秒。
1
Color
Compensation
仪器冷却
50℃; 30秒(sec)
1
SHAPE
6、保存程序后,点击“Start Run”开始运行程序,并保存文件名。
7、在运行界面左侧,选择“Subset Editor”,点击下方“+”号,新建一个子集,命名为“color compensation”,如下图选择进行颜色补偿实验的反应孔后点击“Apply”。
8、在运行界面左侧,选择“Sample Editor”,在“Select Workflow”中选择“Color Comp”,如下图所示;选择相同反应液的6个平行管,并在“Dominant Channel”中,选择与相应的反应管相对应的荧光通道的波长。
第2排: Water;第4排: FAM 465-510; 第6排: HEX 533-580; 第8排: ROX 533-610; 第10排: Cy5 618-660。
9、程序运行结束后,点击界面左侧“Analysis”,选择“Abs Quant/2nd Derivative Max”,进入界面后,点击“Filter Comb”分别查看四个荧光通道的扩增情况,均应有扩增。如下图所示:
8、点击界面左侧“Analysis”,选择“Color Compensation”,在Subset选项中下拉选项框,选择“color compensation”;进入界面后,选中进行颜色补偿实验的通道,点击“Calculate”;然后,点击右下角“Save CC Object”,将文件保存在“Special Date”文件夹下的“CCC”文件夹中,如文件“YDEL Color Compensation”。具体操作如下图所示:
【颜色补偿的使用方法】
在进行Y染色体微缺失检测实验时,运行程序结束后,点击界面左侧“Analysis”,选择“Abs Quant/2nd Derivative Max”。进入界面后,点击下方“Color Comp(off)”下拉选项框,选择“In Database”,在路径中选择已保存的颜色补偿文件,如“YDEL Color Compensation(CC)”;
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