组氨酸精氨酸赖氨酸.ppt

WE ARE FAMILY 李承谦 李沛繁 李岳松 徐子钧 盛子洋 能与DNA结合的 应包括哪些氨基酸 蛋白质 Deoxyribonucleic DNA-binding protein Special amino acid DNA-binding protein —— DNA 结合蛋白 又称DNA解链蛋白，属于DNA解旋酶的一种，可与DNA结合使其解旋 结合 DNA 蛋白质 binding 识别部位具有二度对称性 二度对称结构的二聚体 构成蛋白质的二聚体中，两个单体均具有旋转对称性，且与DNA中碱基的旋转对称性相同。 1. 从DNA与蛋白质的空间结构考虑 2. 从DNA与蛋白质的分子组成考虑 DNA分子的单体为脱氧核苷酸， 脱氧核苷酸由脱氧核糖、磷酸基团、碱基 脱氧核糖对外表现为电中性，很难与外界形成氢键、离子键或者形成范德华力，所以要与DNA结合的蛋白质理论上来说应该是与碱基或者磷酸基团结合。不同的结合部位对应不同的结合方式。 普遍性结合 特异性结合 Polarity electropositive 极性带电 氨基酸 普遍性结合 General binding Phosphate group 磷酸基团 Amino acid 氨基酸 非极性 极性不带电 极性带正电 极性带负电 · 旋转对称性 · 特定距离的相反电荷 · 与氢键基团排布上的匹配 · 形成足够大的范德华力 蛋白质与DNA的主链骨架接触，大多数涉及磷酸基团间磷酸二脂键的氧原子。而氧原子具有较强的电负性，因此容易吸引极性带正电的氨基酸分子，主要包括： 组氨酸 精氨酸 赖氨酸 helix 螺旋区内 氨基酸 特异性结合 Peculiar binding Base pair 碱基对 · 两条等长、反向的多聚脱氧核苷酸链 · 呈双螺旋结构，表面有深沟和浅沟。 · 深沟内存在特异识别信息，可以识别特定的氨基酸。 · 相互识别的氨基酸与碱基结合，形成氢键 特异性结合中的蛋白质通常具有特殊的结构，主要有： 同源盒结构 亮氨酸拉链结构 锌指结构 主要包含的氨基酸有： 亮氨酸 半胱氨酸 组氨酸 表达 实际应用 Example 复制 转录 翻译 DNA连接酶 RNA聚合酶 终止子 启动子 操纵子 Amino acid 氨基酸 亮氨酸 半胱氨酸 组氨酸 精氨酸 组氨酸 赖氨酸 特异性结合 普遍性结合 Thank you!