代谢组学概述.pptVIP

* * * * * 代谢组学概述 目录 3 样品预处理与提取 4 代谢物检测技术 汇报内容 5 数据处理方法 6 研究计划 2 研究对象 1 背景、概念和意义 背景 概念 意义 对基因、mRNA、蛋白质的研究催生了基因组学、转录组学、蛋白质组学。这些组学描述的内容是可能发生的事件，受到诸多环境、饮食、年龄等因素的影响，且会有平衡和反馈机制，这些可能的事件并不一定发生。 传统毒理学实验耗时、难以进行高通量研究，毒性终点单一、难以确定毒性作用机制，多研究致死效应，难以研究低浓度暴露的影响与长期效应。 小分子的产生和代谢才是这一系列事件的最终结果； 其它组学所起的改变会在代谢层面放大，更灵敏； 代谢物结构与功能清楚，数量少，更容易解释其机理变化。 研究背景与意义—优势 代谢组 代谢组学 环境 代谢组学 利用代谢组学技术探讨生物有机体与生态环境之间相互作用的一门学科，着重于研究生物体应对环境影响因素的代谢变化。 研究生物体系受外部刺激所产生的所有代谢产物变化的科学，反映的是外界刺激或遗传修饰的细胞或组织的代谢应答变化。 一个细胞、组织、器官或者一个生物体中在某一特定状态下的所有内源性小分子代谢产物的集合，如氨基酸、糖、有机酸、脂肪酸、核苷、核苷酸等。 研究背景与意义—基本概念 只有第4层次才是真正意义上的代谢组学研究。目前，代谢组学的最终目标还是不可完成的任务。 研究背景与意义—相关分类 定性并半定量分析生物样品中全部代谢物 研究背景与意义—应用 研究背景与意义—原理 研究流程 研究流程 模式识别和统计分析，如PCA、PLS-DA、OPLS-DA等。 解析与机体生理病理有关的生化过程。 应用较多 研究流程—实验对象 血、尿、唾液、眼泪、精液、羊水、脑脊液以及各种腺体的分泌液(胆汁、胰液、肠液) 心、肝、脾、肺、肾、肌肉、骨骼、脊髓、脑组织 动植物细胞、酵母细胞、细菌、真菌、病毒个体 血液被认为是最具研究价值的一种体液，含有多种代谢物，能够较为全面反映生物体的代谢状况。尿液与肾有着密切联系，同时机体代谢、疾病等情况，也会造成尿液中化学组成的改变。肝是进行代谢的主要场所。因此血、尿、肝组织的整合分析在代谢组学研究中发挥着重要作用。 粪便等 研究流程—样本来源 研究流程—样品预处理与提取 除了核磁共振NMR和普通的GC/MS、LC/MS之外，用于代谢组学的分析技术还有气相色谱-飞行时间质谱、超高效液相色谱-飞行时间质谱、傅里叶变换质谱、傅立叶离子回旋共振-质谱和毛细管电泳-质谱联用等。由于代谢产物和生物体系的复杂性，至今为止，尚无一种能满足所有要求的代谢组学分析技术 。只有通过组合不同的分析技术才能够比较全面准确地测定代谢组内容。 方法 优点 缺点 NMR 样品处理简单、无损伤性、测试手段丰富、定性与定量分析、无偏向性、分析快速 灵敏度低 GC/MS 高分辨率、高灵敏度、重复性好、具备完整的数据库、分析成本较低 需衍生化、选择性分析、定量不够准 LC/MS 高灵敏度、动态范围宽、样品处理简单、分析成本较低 破坏性、选择性分析、定量不够准、基质干扰、无数据库 常用的代谢组学分析技术比较 研究流程—检测技术 * * * * * * * * *