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生物芯片原理及技术Microarray Technology in Practice个人信息姓名:张彦婷邮箱:zhangyt@zzu.edu.cn 课程简介参考书目:《生物芯片技术》,陈忠斌编著,化学工业出版社,2005年《生物芯片技术与实践》,[英]史蒂夫 .拉塞尔 等著;肖华胜 等译;科学出版社,2010年课时安排:32学时,16周考试方式: 平时成绩:30% 期末考试:70%课程内容时间内容第1到13周第一章 生物芯片概论第二章 基因芯片第三章 蛋白质芯片第四章 组织芯片和细胞芯片第五章 糖芯片第六章 微流路芯片第七章 芯片试验及数据处理第14、15周生物芯片相关研究(学生)第16周复习第一章 生物芯片概论生物芯片简介生物芯片的产生和发展生物芯片的分类生物芯片的应用2014.9.4芯片计算机芯片电路芯片数字电视芯片显卡芯片A chip is a very small piece of silicon with electronic circuits on it which is part of a computer or other piece of machinery .泛指所有的电子元器件,是在硅板上集合多种电子元器件实现某种特定功能的电路模块。它是电子设备中最重要的部分,承担着运算和存储的功能 。生物芯片生物芯片是信息时代的产物,横跨多个学科生命科学物理学计算机科学微电子学数学化学材料科学等?电脑芯片基因芯片生物芯片是借用电子芯片的概念,是指能够快速并行处理多个样品并对其所包含的各种生物信息进行解剖的微型器件,它的加工运用了微电子工业和微机电系统加工中所采用的一些方法,只是由于其所处理和分析的对象是生物样品,所以叫生物芯片。生物芯片生物芯片: Biochip、Microarrays原理: 1. “芯片” 原理: 微型反应器和处理器 2. “分子杂交”原理: 生物分子间的相互特异识别作用(如:DNA分子之间、蛋白分子之间、DNA与蛋白分子之间以及自组装单分子膜之间等) “芯片” 特征: 高通量、高集成、并行化、微型化、自动化、连续化生物芯片生物芯片分析特点获得的数据实验时间实验时间获得的数据传统方法和生物芯片分析在实验时间和所获得数据之间关系上的比较第一章 生物芯片概论生物芯片简介生物芯片的产生和发展生物芯片的分类生物芯片的应用生物芯片的产生和发展中心法则生物性状的表现均是通过基因表达调控实现的。对基因的表达调控进行研究,是揭示生命本质的必经之路。生物芯片的产生和发展基因组计划19951997199820012012Bacteria, ~1.6 Mb, ~1600 genes Eukaryote, ~13 Mb, ~6000 genesAnimal, ~100 Mb,~10000 genesHuman, ~3 Gb, ~20000 genes Wheat, ~17 Gb, ~100000 genes 随着人类基因组计划(Human genome project)的完成,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以指数级的速度迅速增长。人们发现各种生命功能都设计大量基因的互相调节;系统研究众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。生物芯片的产生和发展基因组计划的完成使研究的重点转移到以全部基因的功能和结构为目标的后基因组时代。不同个体基因变异,不同组织,不同时间等基因表达差异的分析是连接基因组计划和蛋白质组计划最关键的环节。生物芯片的产生和发展How to study?建立新型高通量、系统化的方法对大量的遗传信息进行准确、高效、系统的检测和分析就显得格外重要了。生物芯片的产生和发展芯片是后基因组时代研究的重要技术生物芯片产生和发展SouthernNorthern Blot10Dot Blot102cDNA Microarray103Oligo Microarray105生物芯片产生和发展生物芯片的标志性事件1989年英国科学家Southern申请了有关在固体表面进行DNA杂交的专利。这是有关基因芯片的第一个专利。 1992年世界上第一块原位合成基因芯片在美国Affymetrix 公司诞生。1995年世界上第一块微矩阵基因芯片在美国斯坦福大学实验室诞生。1997年世界上第一张全基因组芯片-酵母芯片完成(斯坦福大学Brown实验室)。它含有6116个基因。The Full Yeast Genome on a Chip6116 Yeast Genes生物芯片产生和发展主要芯片公司Affymetrix—生物芯片革命的领导者 基因芯片技术拥有者Illumina实力直逼Affymetrix ,青出于蓝而胜于蓝 DNA芯片密度之高无人能出其右 Clontech公司
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