基因表达调控过程.ppt

Gene Expression Regulation 基因表达调控的一般原理 DNA-Protein的相互作用模式 原核生物基因的表达调控 真核生物基因的表达调控 原核和真核mRNA结构的比较 Structure of lac operon ?-galactosidase is needed for hydrolysis of lactose 1、处于转录状态的基因上游1000bp以内往往存在100-200bp对DNase I 的Hypersensitive site； 2、处于转录活跃的区域的核小体和H1 蛋白都较少，有时完全没有； 3、转录活跃区C上的5’-甲基化减少； 4、真核基因的多数受正调控，因为 RNA聚合酶对启动子的亲和力极弱，一般情况下需要复数个acti-vator来稳定. 因核小体的存在使得RNA聚合酶无法识别启动子，一定需要别的因子的帮助，因此负调控就显得多余了。这个调控机制适合巨大基因组中只有少量基因需要转录的情况。 核小体是天然的repressor 4、原核细胞的基因表达一般在几分钟内就发生变化，而真核生物的基因表达一般需要数个小时，最快也要30 min； 5、histone acetylation是真核细胞基因表达的前提；histone deacetylase活性高就意味着长寿(why?) 6、为了满足同一个基因 在不同时期不同组织 中的表达，一个基因 往往有多个启动子，通过alternative splicing 来调控； Histone acetyl-transferase histone deacetylases Human Progesterone Receptor: A and B Forms From single gene by alternate transcription initiation (different promoters) Different activities CRE: cAMP response element; TRE: 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate response element; SRE: serum response element; ARE: antioxidants… 真核基因的启动子和调控蛋白 1.浓缩状态的染色质变松散(组蛋白乙酰化酶的作用)； 2.一些活化因子专一性结合到特定DNA序列上，并帮助别的因子的结合，最后打开核小体结构； 3.TFIID等中介蛋白复合物将活化因子和RNA聚合酶拉到一起，稳定转录的起始。 负调控比较罕见 酵母半乳糖代谢相关的基因 分布在3条染色体上, 没有operon,但启动子相同 酵母半乳糖代谢基因转录调控 无葡萄糖时 有葡萄糖时 没有转录 开始转录 Transactivator的结构特征 HMG： high- mobility globulin; PPP：proline-rich activation domain ---：acidic activation domain QQQ：glutamine-rich activation domain * 基因表达失控会导致严重后果 影响蛋白质浓度的 七 个环节 四种转录起始调控的模式 enhancer cis element在DNA上 trans acting factor为蛋白质 (enhancer) 典型的原核操纵子(operon)结构Enhancer和operator的位置 与蛋白质发生相互作用的碱基上的基团 (用红色标识) DNA-蛋白质相互作用范例 1. HTH型(Helix-turn-helix ) Lac repressor 与DNA的结合 Typical HTH-protein: Homeodomain 2. Zinc-finger 蛋白 3. Leucine-zipper 4. Helix-loop-helix 核糖体可以不从mRNA上解离连续合成三个蛋白质 lac operon的正与负调控 ara operon ---- 由同一个蛋白质进行正和负的调控 trp operon中的attenuator SOS 应急反应中的repressor Stringent response DNA重组 进行的基因调控 DNA sequence around lac promotor IPTG可以和repressor结合又不会被?-半乳糖苷酶酶解 LacY LacZ Binding of Lac repressor (阻遏蛋白) to DNA lac operon上共有三个 repressor 结合位点 HTH型的CRP蛋白的结构(cAM