糖尿病大鼠 海马 转录组分析汇总.ppt

zinc finger protein 82，Zfp82 NCvsDM DMvsGL NCvsGH GLvsGH -8.7 9.47 -8.7 -9 胃癌相关 我们具体分析时的组别说明：正常组:NC，糖尿病+生理盐水灌胃组:DM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:GL，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：GH * Content Layouts 糖尿病（DM）大鼠水迷宫分析及海马组织RNA-seq汇报 研究背景及假设1 认知的解剖学基础 糖尿病认知障碍 糖尿病认知功能障碍是近年来发现的糖尿病慢性并发症之一[1] 海马是认知功能中学习记忆的神经生物学基础。[2] 假设1 糖尿病认知功能障碍的发生主要与海马部位的哪些信号通路变化有关？ [1] Arvanitakis Z, Wilson R S, Bienias J L, et al. Diabetes mellitus and risk of Alzheimer disease and decline in cognitive function.[J]. Archives of Neurology, 2004, 61(5):661-666. [2] ?Morris R, Anderson E, Lynch G, Baudry M (1986). Selective impairment of learning and blockade of long-term potentiation by an N-methyl-D-aspartate receptor antagonist, AP5.?Nature.?319?(6056): 774–6. 研究背景及假设2 天麻素 支持保护神经 [1][2] 天麻素（Gastrodin）改善糖尿病大鼠认知功能是通过哪些最关键的信号通路或因子发挥作用？（这是我们尤为感兴趣的问题） 假设2 [1]孙新亭, 孙晓静. 天麻素对脑外伤大鼠认知功能的影响及机制研究[J]. 中国康复医学杂志, 2014, 29(6):517-520. [2]王昭君, 习杨彦彬, 刘佳,等. 天麻素对快速衰老小鼠大脑组织衰老相关基因表达的影响[J]. 解剖科学进展, 2007, 13(4):353-357. 实验技术路线 SD大鼠分组 糖尿病+生理盐水组（DM） 糖尿病+天麻素低剂量组（G60） 正常组(NC) 统计分析 糖尿病+天麻素高剂量组（G120） STZ诱导糖尿病组 免疫荧光 HE 样本收集 水迷宫测试及行为学分析 WB RNA-seq G60: 指糖尿病大鼠给天麻素（Gastrodin）的剂量为60mg/kg，为低剂量组； G120：指糖尿病大鼠给天麻素（Gastrodin）的剂量为120mg/kg，为高剂量组； 已做实验研究 1、行为学测试（Morris水迷宫） 2、RNA-seq研究 水迷宫（逃避潜伏期） 1.DM疾病组显示出逃避潜伏期的延长， 2. DM+天麻素（Gastrodin）组逃避潜伏期延长但较疾病组情况好， 3. 且G60组（低剂量组）效果较G120组（高剂量组）好。 水迷宫（目标象限停留时间） DM疾病组显示出目标象限停留时间的减少， 疾病+天麻素组（G）目标象限停留时间减少幅度较疾病组小， G60组显示出较好的效果。 水迷宫（穿越平台次数） DM疾病组穿越平台次数减少， 疾病+给天麻素（G）组穿越平台次数减少但较疾病组稍有改善， 且G60组效果较好。 RNA-seq 差异表达基因（DEG） 公司报告中的组别说明：正常组:HNC，糖尿病+生理盐水灌胃组:HDM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:HG-L，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：HG-H 嗅球、海马、小脑基因表达差异 DEG筛选 纳入排除原则： 1、符合水迷宫各组变化趋势 2、变化倍率（Folder Change，FC）≥2 3、FC＜2但与神经系统病变有关 我们具体分析时的组别说明：正常组:NC，糖尿病+生理盐水灌胃组:DM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:GL，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：GH 筛选基因 我们分析时用的组别说明：正常组:NC，糖尿病+生理盐水灌胃组:DM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:GL，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：GH KEGG（京都基因与基因组百科全书）中有明确pathway的基因 公司报告中的组别说明：正常组:HNC，糖尿病+生理盐水灌胃组:HDM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:HG-L，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：HG-H 我们具体分析时的组别说明：正常组:NC，糖尿病+生理盐水灌胃组:DM，糖尿病+低剂量天麻素灌胃组:GL，糖尿病+高剂量天麻素灌胃组：GH 39S ribosomal protein L1 mitochondrial，Mrpl1 ID NCvsDM DMvsGL