Lammps-安装步骤详解.docVIP

一 lamps非并行安装 1 在终端输入： cd /mnt （源码包lammps.tar.gz放在/mnt下 (cp /home/lab/Desktop/lammps.tar.gz /mnt)） gunzip lamps.tar.gz tar xvf lamps.tar mv lammps-5Dec10 lmp (重命名为lmp) cd lmp/src/STUBS make clean make cd /mnt/lmp/src/MAKE vi Makefile.serial 后出现 # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, no MPI,no FFTSHELL = /bin/sh# ---------------------------------------------------------------------# compiler/linker settings# specify flags and libraries needed for your compilerCC =??? ??? g++4 g++4该为g++CCFLAGS =??? -g -ODEPFLAGS =??? -MLINK =??? ??? g++4 cd /mnt/lmp/src make clean-all make serial 之后linux开始编译，最后会在/mnt/lmp/src下生成lmp_serial的可执行文件。 mv lmp_serial lmp 2 计算一example 终端输入： cd /mnt/lmp/e*/shear cp /mnt/lmp/src/lmp /mnt/lmp/e*/shear ./lmpin.shear 即开始计算 二lammps的并行安装 1 安装fftw 终端输入: cd /mnt gunzip fftw-2.1.5.tar.gz (源码包fftw-2.1.5.tar.gz在 /mnt下) tar xvf fftw-2.1.5.tar cd fftw-2.1.5 ./configure –prefix=/opt/fftw --enable -float make make install (fftw-2.1.5即安装在/opt/fftw下) 2 安装mpich 终端输入: cd /mnt gunzip mpich2-1.3.1.tar.gz tar xvf mpich2-1.3.1.tar cd /mpich2-1.3.1 ./configure –prefix==/opt/mpich make make install (mpich即安装在/opt/mpich下) 然后配置环境变量 终端输入: cd vi .bashrc 开始编译为 If [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi export PATH=/opt/mpich/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich/lib:/opt/fftw/lib:$LD_LIBRARY_PATH 3 安装lammps cd /mnt gunzip lammps.tar.gz tar xvf lammps.tar mv lammps-5Dec10 lmp cd /lmp/src make yes-all make no-gpu make no-user-atc (几个特殊的package:meam,poems,reax,gpu,user-atc需要特别安装，如下) cd /mnt/lmp/lib/meam ls make –f Makefile.gfortran (安装meam) cd /mnt/lmp/lib/poems ls make –f Makefile.g++ cd /mnt/lmp/lib/reax ls make –f Makefile.gfortran (然后对Makefile.serial文件进行编译) cd /mnt/lmp/src/MAKE vi Makefile.serial (按下i可修改) # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, MPICH2, FFTWSHELL = /bin/sh# ---------------------------------------------------------------------# compiler/linker settings# specify flags and libraries needed for your co