2第二章生物信息数据库：2序列注释格式1.pptVIP

分子数据库结构 曹毅 GenBank数据库结构 作用：了解序列数据库的格式，有助于更好地提高数据库检索的效率和准确性。 DDBJ数据库的内容和格式与GenBank相同，此处不作详细介绍。 分别介绍EMBL和GenBank的数据库结构 GenBank数据库数据注释(/genbank/ ) GenBank库包含所有已知的核酸序列和蛋白质序列, 以及与它们相关的文献著作和生物学注释。 NCBI可提供广泛的数据查询、序列相似性搜索以及其它分析服务。 数据库 序列文件：注释内容——文章 索引文件：检索目录——文摘 GenBank数据库结构 完整的 GenBank数据库包括序列文件，索引文件以及其它有关文件。 索引文件是根据数据库中作者、参考文献等建立的，用于数据库查询。 GenPept是由GenBank中的核酸序列翻译而得到的蛋白质序列数据库 数据格式为FastA。 GenBank数据记录 GenBank数据记录 GenBank数据库结构 GenBank中最常用的是序列文件。 序列文件的基本单位：是序列条目，包括核苷酸碱基排列顺序和注释两部分。 生物信息资源中心通过计算机网络提供该数据库文件。 注释条目：文章的格式 GenBank数据库结构 GenBank序列文件由单个的序列条目组成。 序列条目由字段组成，每个字段由关键字起始，后面为该字段的具体说明。 字段分若干次子字段，以次关键字或