药物及生物活性小分子发现与分子设计.pptVIP

药物及生物活性小分子发现 与分子设计 3 1 2 4 SwissTargetPrediction DDI-CPI SEPPA 2.0 ProTox 5 总结与展望 SwissTargetPrediction 映射活性小分子的目标分子可以预测潜在机理和副作用 ——用于生物活性小分子靶点预测 生物活性小分子连接到蛋白或者大尺寸目标分子来调节生物活性： SwissTargetPrediction ——用于生物活性小分子靶点预测 特点： 结合2D和3D相似性测量； 预测可针对五个不同生命体； 数据集包括280381个小分子与2686个目标相互作用，其中66％的目标是人类的； 3D相似性计算： 18维特征实数向量： 每个分子通过ChemAxon molconvert工具生成20个同分异构体； 超过20个时，选择能量最低的构象；不足20个时，则选择全部构象； Manhattan距离： 构象x和y特征的曼哈顿距离计算公式： 最终的3D相似值计算公式： dij是20×20组里最小曼哈顿距离，所以s’1是其中最大值。 SwissTargetPrediction ——用于生物活性小分子靶点预测 2D相似性计算： 指纹描述分子： 分子指纹是一个多“位(bit)”的编码，每一位代表着某种预定义的子结构； 如果该子结构在某分子中存在；其分子指纹的对应位就是1，否则就是0； 谷本(Tani