检测晶体常出现的错误.docVIP

问题： 问题： _diffrn_measured_fraction_theta_full Low ....... 0.93 采集数据的完成度偏低，通常要在 0.97 以上。最好是重新收集数据。 解决方法：omit 0 50 问题： No sus on H-atoms, but refinement reported as . mixed 报告中显示对 H 原子的修正方法是混合模式但没有列出 H 原子相关的偏差。 解决方法：把.CIF 中的 mixed 改成 constr 就可以了。 问题： CIF Contains no X-H Bonds ...................... ? CIF Contains no X-Y-H or H-Y-H Angles .......... ? 解决方法：在 ins 文件中将 Bond 改为 Bond $h 命令,再在 XL 中精修一下就可以 了 问题： PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................ 0.37 修正轮数不够多 Maximum Shift/Error 值应该接近于 0，至少要在 0.02 以下。 解决方法：增加修正轮数（L.S. 后的数值改大） 问题： PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 7.95 Ratio PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 7.78 Ratio 这二条是指原子有较大的非正定，说明没有修正好。 解决方法：可以考虑将这个有较大无序的 O 进行分比（如占位率 0.5：0.5）再修。 如果是衍射数据质量不够好而无法得到好的修正结果，那只有重新采集数据了。 问题： DENSX01_ALERT_1_A The ratio of the calculated to measured crystal density lies outside the range 0.80 1.20 Calculated density = 1.753 Measured density = 0.000 PLAT093_ALERT_1_A No sus on H-atoms, but refinement reported as . mixed 解决方法：在 cif 里将_exptl_crystal_density_meas 0 改为：_exptl_crystal_density_meas ? 将_refine_ls_hydrogen_treatment mixed 改为：_refine_ls_hydrogen_treatment constr PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C3 is NPD ..................... ? 解决方法：原子非正定，无序或者空间群错误， 或者数据不好。这个原子如果 在结构中不甚重要，可以按各向同性处理，一般不影响发表 。用 ISOR 命令各 向同性，应该可以解决。 问题： Hirshfeld Test Diff for C1 - C2 .. 7.53 su 解决方法：ins 文件里加入 delu 0.02 c1 c2 （delu 限制所指定的原子具有接近指定范围内的位移参数） 问题： PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing .. ? PLAT057_ALERT_3_C Correction for Absorption Required RT(exp) ... 1.11 解决方法：主要注意 cif 文件中的以下这几行，_exptl_absorpt_correction_type 这 一项只要做了 xcif 就一般会自动填 Multi-scan，你也可根据自己的校正方法来 填。 一般可能出的问题就是这几行填得串了行，或者 T_min 与 T_max 填反了。仔细 检查 问题： PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.83 Ratio 解决方法：simu 0.01 0.02 3.8 $c （simu 限制在一定范围内的原子具有相同的位移参数） 问题： 解 完 晶 体 后 check cif 出 现 A 类 错 误 No s.u. Given for Flack Parameter .............. ? 不知道如何解决 解决方法：你这个结构是否有手性？ 1. 如