研究生数学建模竞赛优秀论文基于临床与基因图谱的结肠癌基因标签提取.pdfVIP

全国第七届研究生数学建模竞赛 全国第七届研究生数学建模竞赛 题 目 基于临床与基因图谱的结肠癌基因标签提取 摘 要 由于基因间的调控和相互作用表现为 功能基因组合”形式，基因的功能与 作用是集体作用的结果，而非单个基因单独作用的结果，表现在分类特征对样本 的分类能力方面就是以特征集合的形式整体体现出来的。根据这个生物学知识， 本文考察由多个基因构成的基因簇作为区分正常人和癌症患者的分类因素，利用 独立成分分析 (ICA)技术对已给出的基因表达采样数据进行分析，最大程度地降 低基因之间强烈的相互影响，从而获得对判断是否患有肿瘤或者癌症的最有直接 关系但数目较少的潜在因素，即基因簇信息。随后，我们采用了支持向量机 (SVM) 依据提取出的潜在因素 （基因簇）进行分类，筛选出致病的癌症基因15个。另外， 我们还运用基于灵敏度的支持向量机对基因本身进行分类，而不是基于基因簇。 利用得到的结果与基于独立成分分析的方法所提取的基因提供比较。发现所筛选 的基因簇中有三个基因与灵敏度支持向量机方法筛