草案的甜橙基因组.docVIP

草案的甜橙基因组(类) 文摘 桔子是一种很重要的营养来源,人类健康和具有巨大的经济价值。在这里,我们提出一个综合分析基因组草案的甜橙(类)。装配序列覆盖87.3%的估计橙色基因组,这是相对紧凑,20%是由重复的元素。我们预测29445个蛋白编码基因,其中一半是杂合???状态。与其他两个柑橘类物种的测序和比较分析七个柑橘的基因组,我们目前的证据表明,甜橙起源于一个回交柚子和普通话之间的混合。集中在维生素C代谢相关基因分析表明,GalUR,编码galacturonate途径的限速酶,在橙果显著调节,这个基因家族的最近的扩张可能会提供一个基因组的基础。这个草案基因组代表一个宝贵的资源对于理解和改善在未来许多重要的柑橘类特征。 left 图1 图2 图1 图2 图3 图4 介绍 柑橘是一个大属,包括几个主要栽培品种,包括c .喹酮(甜橙),试(橘子和普通话),柠檬(柠檬),茅(柚子)和柑橘paradisi(葡萄柚)。2009年,全球种植面积是900万公顷,柑橘产量1.223亿吨(粮农组织统计,见url),这是排名最高的在所有的水果作物。1090万吨(价值?$93亿)柑橘产品的交易在2009年,甜橙占大约60%的柑橘生产新鲜水果和果汁加工消费(粮农组织统计,见url)。此外,柑橘类水果和果汁是人类的主要来源,维生素C、人类营养的一个重要组成部分。 柑橘类水果也有一些独特的植物特性,如珠心的embryony(珠心细胞可以发育成单性生殖的胚胎基因完全相同的母亲植物)。因此,体细胞胚胎的生长比合子的胚胎更大力的种子,种苗本质上是克隆母体的父母。这样citrus-unique特点阻碍了柑橘遗传和育种研究改进 \o 自夸,马丁接近,柑橘T.J.基因组学,热带和亚热带地区的主要水果作物。热带农作物(eds的基因组。摩尔,由P.H. 明扮演r .)187 - 201(施普林格出版社,2008年)。 \t /translate_url?rurl=http%3A%2F%2F%2Furl=http%3A%2F%2F%2Fng%2Fjournal%2Fv45%2Fn1%2Ffull%2Fng.2472.htmltype=AUTOusg=youdaowebfanyi1724444996057264817m385502293keyfrom=fanyi.web.index 1, \o Gmitter,F.G. et al .柑橘基因组学。树麝猫。基因组8,611 - 626(2012)。 \t /translate_url?rurl=http%3A%2F%2F%2Furl=http%3A%2F%2F%2Fng%2Fjournal%2Fv45%2Fn1%2Ffull%2Fng.2472.htmltype=AUTOusg=youdaowebfanyi1724444996057264817m385502293keyfrom=fanyi.web.index 2。完整的基因组序列将提供有价值的遗传资源为提高柑橘作物。 柑橘被认为是原产于东南亚 \o 韦伯,H.J.柑橘产业的历史和发展。在柑橘产业(eds。路德、w . et al。)1、章1-39(加州大学出版社,1967年)。 \t /translate_url?rurl=http%3A%2F%2F%2Furl=http%3A%2F%2F%2Fng%2Fjournal%2Fv45%2Fn1%2Ffull%2Fng.2472.htmltype=AUTOusg=youdaowebfanyi1724444996057264817m385502293keyfrom=fanyi.web.index 3, \o Scora,R.W.柑橘的历史和起源。公牛。托里机器人。102年俱乐部,369 - 375(1975)。 \t /translate_url?rurl=http%3A%2F%2F%2Furl=http%3A%2F%2F%2Fng%2Fjournal%2Fv45%2Fn1%2Ffull%2Fng.2472.htmltype=AUTOusg=youdaowebfanyi1724444996057264817m385502293keyfrom=fanyi.web.index 4, \o Gmitter,f . 胡锦涛x云南省的可能作用,中国当代柑橘类物种的起源(芸香料)。经济。机器人。44岁,267 - 277(1990)。 \t /translate_url?rurl=http%3A%2F%2F%2Furl=http%3A%2F%2F%2Fng%2Fjournal%2Fv45%2Fn1%2Ffull%2Fng.2472.htmltype=AUTOusg=youdaowebfanyi172