G鄄四链体与配体相互作用的研究方法进展.pdf

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2015, 42(7): 624~638 G 链体与配体相互作用的研究方法进展* ** 魏强 屈 锋 龚 芮 (北京理工大学生命学院，北京 100081) 摘要 核酸的G- 四链体结构在原核生物和真核生物的基因组中广泛存在，并参与基因复制和重组、端粒延伸、基因表达调 控等多种重要的生物学过程 G- 四链体与配体如Telomestatin 、TMPyP4 、BRACO-19、RHPS4 等的相互作用研究有助于阐 明其生物学功能 G- 四链体与配体分子间的相互作用研究应用多种分析方法，如硫酸二甲酯印迹、凝胶迁移、聚合酶终止 实验等生物化学法，而现代分析技术包含圆二色谱、荧光光谱、荧光共振能量转移、核磁共振、X- 射线晶体衍射等光谱法， 以及表面等离子体共振、电喷雾质谱和毛细管电泳法等 本文综述了可与G- 四链体结合的配体以及G- 四链体与配体相互作 用的研究方法，并对各种方法进行了比较 关键词 G- 四链体，配体，相互作用，研究方法 学科分类号 O657，Q52 DOI: 10.16476/j.pibb.20 15.0061 四链螺旋结构 的核酸称为 G- 四链体 (G-quadruplex)，与经典的DNA 双螺旋结构明显不 1 G 链体研究的生物学意义 同 4 个鸟嘌呤碱基通过Hoogsteen 氢键配对形 G- 四链体结构最初都是在体外环境(in v itro) 中 成正方形的G 平面(G-tetrad)，适当体积的阳离子 发现的，如端粒末端的DNA 重复序列或其他富含 或配体可以促使多个G 平面堆叠形成G- 四链体结 + + + G 的寡核苷酸，在一些含阳离子如K 、Na 、NH4 构[1] 研究发现，G- 四链体在生物体内普遍存在， 的缓冲溶液中经过变性和退火的处理可自发形成 并参与基因复制与重组、端粒延伸、基因表达调控 G- 四链体结构[7-8] 随着X- 射线、核磁共振、分子 [2] 等多种生物学过程 ，它不仅与细胞衰老、凋亡、 荧光、全组基因分析等方法的应用，进一步发现 免疫系统功能等密切相关，也参与肿瘤和基因疾病 G- 四链体广泛存在于生物体内(in v ivo) 的DNA 和 [3-4] 的发生 已知一些配体(ligands)，如可与G- 四 RNA 中[2-3, 9-12] 不仅是在染色体DNA 末端的端粒 链体特异性识别并结合的Telomestatin 、TMPyP4 、 [13-14] [15-16] 区 ，在原癌基因的启动子区 ，信使RNA 的 BRACO-19、RHPS4 等，以G- 四链体为靶点，通 5 端非翻译区(5 -UTR)[17]等都能够形成G- 四链体 过稳定G- 四链体结构或促进G- 四链体的形成进 结构 而抑制癌细胞的增殖[5-6] 近年来，G- 四链体与配 G- 四链体结构在维护基因稳定、保持端粒长 体作用的研究也是肿瘤治疗和防治的热点研究之一. 、调控基因转录与翻译表达以及基因重组等生命 G- 四链体与配体的相互作用研究依赖于高分 过程中都具有很重要的作用[18-22] 例如真核生物体 辨、高灵敏的技 和方法 圆二色谱(CD)