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总RNA 提取实验原理、步骤和问题解答
Trizol试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA 的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持 RNA 的完整性,裂
解细胞并释放出 RNA, 酸性条件使 RNA 与 DNA 分离 ,加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。 RNA 存
在于水样层中。收集上面的的水样层后, RNA 可以通过异丙醇沉淀来还原。在除去水样层后,样品中的
DNA 和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙醇沉淀能析出中间层的 DNA ,在有机层中加入异丙醇能沉淀
出蛋白。共纯化 DNA对于样品间标准化 RNA 的产量十分有用。
无论是人、动物、 植物还是细菌组织, 各种样品最大使用量 ( 1ml Trizol ),动物组织( 50mg) ,植物组织(100
mg) ,丝状真菌 ( 100mg) ,动物细胞 (5×106 ~ 1×107) ,酵母 (1×107) 。
TRIZOL试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种 RNA 的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的 RNA琼脂糖
凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于 7 kb 和 15 kb 之间不连续的高分子量条带, ( mRNA 和 hnRNA
成分)两条优势核糖体 RNA 条带位于 ~5 kb (28S) 和 ~2 kb (18S) ,低分子量 RNA 介于 0.1 和 0.3 kb 之间
(tRNA, 5S) 。当抽提的 RNA 用 TE 稀释时其 A260/A280 比值≥ 1.8 。
[实验用品 ]
【实验耗材】
1、移液枪: 1ml、200 μl、20μl、 10μl、 2μl。酒精擦拭,头部重点,紫外线照射。
2、吸头: 1ml、200 μl、 20μl
3、匀浆管: 5ml
4、吸头台:放置 1ml 吸头的一个,放置 20 μl 吸头的一个
5、 EP 管: 1.5ml 、 0.2ml 、100 μl
6、试剂瓶: 2个 60ml 的棕色广口试剂瓶。青霉素小瓶(分装无水乙醇,高压的 DEPC 水,- 20 °C 保存)。
7、量筒: 50ml 、 250ml 、500ml
8、容量瓶: 250ml 、500ml 、1000ml
9、试管架: 5ml、1.5ml 、 20μl
10、盐水瓶: 250ml 、500ml 各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装 DEPC 水
11、铝制饭盒: 4个
12、塑料小饭盒: 1个
13、大瓷缸: 2个
14、锡泊纸:一卷
15、卷纸: 2卷
16、三角烧瓶:带盖,稍大(融琼脂糖)
【实验仪器】
天平、振荡器、高速离心机、 0.5~10ul 、 20~200ul 、 100~ 1000ul 加样器。
【自备试剂】
DEPC( 焦碳酸二乙酯),氯仿,异丙醇,无水乙醇, 0.05 ~0.1 %DEPC -H2O ,75%乙醇, TE缓冲液,琼脂
糖。
RNA 抽提的准备工作
【试剂配制】
1.DEPC 水: 1ml+ 1000ml 双蒸水= 1‰ DEPC 水, 1000ml 容量瓶中静置 4小时。
2.75% 乙醇:无水乙醇 +DEPC 水, -20 ℃保存( DEPC 水需先高压)
3.氯仿:棕色瓶
4.异丙醇:棕色瓶
【器具处理与准备】
1.塑料制品:(包括枪头、 EP 管、匀浆管等)
先将 DEPC 水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,小枪头需打入 DEPC 水,室温过夜,高
压,烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次( EP 管)。胶塞同样处理。塑料器皿也可在 0.5 M
NaOH 中浸泡 10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。
2.玻璃制品:
泡酸过夜,冲洗干净, 1 ‰ DEPC 过夜,蒙锡纸, 150 °C 烘烤4h,180 °C,2h。或泡酸过夜,冲洗干净后
高温烘烤, 1 ‰ DEPC 过夜,高压。盛装乙醇, DEPC 水用。
3.匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,再高压(不需要泡 DEPC )
[实验内容和方法 ]
一、抽提
(一)组织抽提
1.组织取材后用灭菌的锡箔纸包好保存于液氮。实验时,在液氮中将组织研磨成粉末,趁液氮未挥发将粉
末转移到 EP 管,室温 5000rpm 离心去上清。每 50-100mg 组织,加入 1ml Trizol 。
2.若是新鲜标本经匀浆后转移离心管,加入 1ml Trizol 。
3.若组织量 (1~10 mg) 或细胞数很少 (102 ~104) ,在样品中加入 800 ul Trizol 反复抽吸均匀, 再加入糖原 (终
250ug/ml), 剧烈振荡或用匀浆器匀浆。
4.在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在 –60~70 °C 保存至少一个月。
(二)细胞抽提
1.倒掉培养基, PBS 洗,直接将 1ml Trizol 注入培养瓶( 5×106 ),反复
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