细菌的分类以及命名.pptVIP

API—细菌鉴定系统 2、Enterotube 系统 不同培养基分装不同小槽中，同步接种，培养后检测、查表、鉴定。 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 自动化、快速 可鉴定细菌有1140多种、酵母菌267种、目前已经可用于丝状真菌。 每个孔中含有不同的底物 菌悬液或无菌水 （一）经典分类法 将形态、结构特征作为初步特征，再比较生理、生化特征，采用双歧法整理结果，进行分类。 是通过广泛比较分类单位的性状特征，然后计算它们的相似性，再根据相似性的数值划分类群的一种分类方法。 至少50－60个性状以上 同等重要 只能划分到类群 （二）数值分类法 方法步骤 根据较多特征分类，每一特征地位相同。1、每一菌株为一操作单位，确定很多特征（50—60 个） 2、比较菌株间的最大相似性阳性和阴性符合的总和---------------------------------× 100%总的测定数 --- 无效测定数85%为同种，65%为同属 3、据数值绘出矩阵图并转换成树状谱。 （三）分子与遗传方法 1、DNA碱基组成：G+C%相同不能说明是同种，但不同则肯定不是同种。差别10%不是同种，10%可能是同种。 2、核酸分子杂交比较碱基顺序的同源性 3、16s rRNA寡核苷酸编目分析 水解rRNA产生一系列寡核苷酸片段，顺序分析。近年来，采用红外、核磁、电镜等新技术越来越广泛。 四、分类系统 原核生物：《伯杰氏系统细菌学手册》第1版， 1984－－1989 重要的G-细菌 1－11组 G+细菌 12－17组 光合菌、蓝细菌、古细菌等 18－25组 放线菌 26－33 组 《伯杰氏系统细菌学手册》第2版， 分为5卷 古生菌域 泉古生菌门 广古生菌门 2门8纲－－－208个种 细菌域 23门31纲－－4727个种 （沈萍） （周德庆） 最新资料（沈萍第四版微生物学实验） 已记载描述： 古生菌 520种；细菌 19858种； 真核生物 120336种 国际承认：古生菌、细菌、放线菌 为7329种，442个亚种 分属58纲，81目，1399属 真菌：ainsworth (1983)系统 粘菌门 菌物界 鞭毛菌亚门 接合菌亚门 真菌门 子囊菌亚门 担子菌亚门 半知菌亚门 第八版 1995年 原生生物界 真核 假菌界 卵菌类 生物域 子囊菌门、担子菌门 真菌界 壶菌门、接合菌门 有丝孢真菌类 酵母：lodder分类系统 菌种鉴定工作三部曲1、获得该微生物的纯培养2、测定一系列必要的鉴定指标3、查找权威性鉴定手册 第十二章 微生物的进化、系统发育和 分类鉴定 序：进化的概念： 两种分类原则： 第一节 进化的测量指征 一，进化指征的选择 二，rRNA作为进化指征 16SrRNA 特点 * * 16S rRNA特点： 1、16SrRNA存在于所有生物中并执行相同的功能—合成蛋白质。 2、 进化相对保守，分子序列变化缓慢； 3、相对分子质量适中； 4、16S rRNA普遍存在（真核生物为18SrRNA)； 5、微生物的16S rRNA可从样品中直接提取，分析、比较其序列，进而确定其家族树中位置 全生命系统树－－ (Olsen Woese 1993) 三，三界生物的主要特征 微生物分类学 微生物分类学 一门按微生物的亲缘关系把他们分门别类的排成各种分类单元或分类群的学科 分类学任务 分类、鉴定、命名 微生物分类学的发展 经典分类学 微生物系统学 一，分类单元及等级 界 Kingdom 原核生物界 门 phylum 细菌门 纲 class