《细菌全基因组测序》.pptVIP

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  • 2019-12-02 发布于天津
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基因组测序 和组装流程;生物信息学分析流程图 ;基因功能注释;B-6 KEGG代谢通路二级分类图 ;B-9 KEGG代谢通路二级分类图 ;B-6 COG功能分类图 ;B-9 COG功能分类图 ;B-6 GC含量、GC skew、 COG 注释基因组分布图 ;B-9 GC含量、GC skew、 COG 注释基因组分布图 ;基因家族(gene family) 和基因簇(gene cluster)分析;测序数据的解读与分析; 解读策略 木质素降解过程涉及到的其他酶。 对木质素模型化合物作用的相关酶; 木质素单体化合物降解相关酶。;聚合木质素;;木质素降解有关主要的酶和它们催化的主要反应; 增加个性化信息分析 对B-6,B-7,B-8,B-9这4株菌的数据进行分析,寻找与木质素降解相关基因; 用CAZY数据库对这4株菌的代谢途径进行注释,寻找纤维素、半纤维素降解家族基因。 对4株菌的亲缘关系进行分析,确定菌株之间的相互关系; 通过对4株菌进行进化分析,判定是否为古菌或新的菌种。;下一步的实验安排;未注释出功能的基因鉴定,挖掘新基因;其他方面的应用研究;“一个物种基因组计划的完成, 就意味着这一物种学科和产业发展的新开端” 向仲怀院士;dsfdbsy384y982ythb3oibt4oy39y409705923y09y53b

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