遗传多态性及正向选择检测.pdfVIP

浙江大学/bioinplant/ 《生物信息学札记》 樊龙江 第八章 遗传多态性及正向选择检测 《物种起源》的发表距今刚好150周年，进化理论的发展也经历了一个漫长而 曲折的过程。以哈迪温伯格遗传平衡定律为基础，群体遗传学三巨头：Fisher ， Haldane和Wright 建立了群体遗传学的数学基础和理论框架。群体遗传学以数学和 统计学的手段研究群体结构的变化，对影响群体结构的因素如环境、遗传变异、 遗传漂变、迁移进行了研究。分子群体遗传学在自然选择进化论与Kimura 中性进 化论的争议声中不断发展。在经典群体遗传学的基础上，以DNA等分子序列为研 究对象的分子群体遗传学为种群演化的研究提供了数据来源，并将研究领域扩展 到新的层次。伴随着中性理论的挑战和分子群体遗传学的发展，自然选择本身也 在不断发展，选择的概念不断细化，正向选择，负向选择，平衡选择等不同进化 方式的机制得到深入的研究。尤其是受正向选择位点为揭示一些重要的基因座位 的进化历史和遗传动力提供了重要的信息。随着大量分子水平上检测到自然选择 作用的证据出现，Ohta对中性理论进行了修改，提出了“近- 中性”进化理论 （near-neutrality ），认为“突变-漂变-选择”三者在分子进化中同时起作用。自然