《一种基于结构序列藕合模块辨别人类miRNA前体的新方法_》-精选课件(公开).pptVIP

一种基于结构序列藕合模块辨别人类miRNA前体的新方法 * * miRNA的产生 内容提要 miRNA概述 Mirident方法流程结果 与已有的方法的比较 讨论 miRNA的产生——中心法则 Protein Gene mRNA Protein miRNA gene 蛋白基因1 miRNA基因 DNA序列 转录 翻译 转录 pri-miRNA miRNA的产生 行使功能 miRNA的产生 miRNA概述 长约20~25碱基的单链RNA 功能：在对mRNA进行转录后调控 ——mRNA 降解 ——阻止mRNA翻译成蛋白 通过影响mRNA从而对生物体的生长、发育起到重要作用，与肿瘤的形成有很大关系。 miRNA的发现： 试验的方法 计算方法（分类算法） 各种机器学习方法用于预测miRNA. SVM, 随机树，线性规划，隐马氏模型等。 2. 机器学习的方法的关键之一是选取合适的特征。常用的特征： 序列特征(如，保守性，G C含量,) 结构特征(臂的长度，loop长度) 本文想法： 充分挖掘序列和结构耦合的特征。 用耦合特征辨别miRNA和假pre-miRNA. 已有方法的局限性： 受对miRNA认识的限制 一般分别考虑序列和结构的性质，大部分没有充分考虑序列和结构之间的相互