UVC诱导的嗜盐细菌(Halococcus hamelinensis)溶解基质的DNA损伤修复的分子鉴定.docVIP

UVC诱导的嗜盐细菌（Halococcus hamelinensis）溶解基质的DNA损伤修复的 分子鉴定 摘要：我们从鲨鱼湾（澳大利亚西部）的有生命的叠层石分离到了嗜盐古细菌（Halococcus hamelinensis），众所周知这些嗜盐古细菌抑制暴露在极端的盐度，干旱和UV辐射的条件下。现代叠石层被认为是地球上早期生命的同源物，并且也因此乘务了现代叠石层的存在位置，并且Halococcus hamelinensis是用来检测古细菌对高强度UV辐射的最特别，以及最合适的候选对象。把这种有机体暴露于高剂量（上限500 J/m 2）的标准杀菌UVC（254nm）辐射下，并且评估了包括存活、TT环丁烷嘧啶二聚体（CPDs）的形成 、以及DNA修复在内的所有效应。结果显示，Hcc. Hamelinensis能够在高强度的UVC辐射下生存，并且完整的细胞表现出增加的DNA保护水平（通过春化DNA），有机体会部分屏蔽来进行类似细菌的核酸切除修复(NER)基因：uvrA, uvrB, uvrC，也包括光聚酶phr2基因。这4种基因已经全部发现了，并且我们还调查研究了光照或者黑暗条件下，这些基因再修复过程中的表达水平的变化，通过实时定量PCR（Real-Time (qRT) PCR）的方式链检测这种水平的变化。在两种修复条件下，在本研究中我们获得的和呈现的数据显示uvrA, uvrB, 和 uvrC基因会受到正调节。在暗修复过程中光聚酶phr2基因会被诱导，而在光照条件下的修复过程中光聚酶phr2基因呈20倍的增长。本研究中呈现出来的数据是对Halococcus（盐球菌属）在暴露在高强度UVC水平后的不同修复机制的进行的第一次分子生物学研究。 关键词： 嗜盐古细菌 ；DNA损伤 ；修复机制 ；UVC辐射 ；太空生物学 1 引言 保护和修复它们的DNA过程，对有机体维持它们的基因组是非常关键的。UVR是最普遍的环境诱变剂，在地球生命进化的过程中是一种重要的环境控制控制因子，并且它们对现代日常生活有着深远的影响[1]。然而，除了它的有害效应之外，UVR在生命进化的过程中起着着非常重要的作用，他是一种有效的天然存在的诱变因素，能够是有机体产生遗传多态现象，是生命进化的基础[1,2]。 生命蓬勃发展的远古时代(3.8–2.5 Ga ago), 有机体不得不应对UV辐射的(220 nm)的影响，UV辐射带来的生物学影响要比先前(290 nm)高1000倍，由于缺乏平流层的臭氧层，臭氧层是在2 Ga之前形成的，它充当着一种有效的UV屏障[3,4]。 在远古时代也存在嗜盐古细菌，因此成为我们用于高UVC辐射对微生物影响的最佳研究对象。现如今，嗜盐古细菌正在剧烈的太阳辐射造成的蒸发态高盐 极端环境下生长[5]。我们已经广泛研究了古生菌中盐杆菌科的一些典型代表，它们对于高UVR辐射的反应(例如., 嗜盐杆菌属sp. [6–9] 和 沃氏富盐菌[10])。这个家族的成员是通过优化它们自身的基因组和蛋白质组的结构来降低UVR引起的损伤[11]。例如，嗜盐菌NRC-1不仅能够在高剂量的UVC辐射的情况下生长，并且还具有有效的机制来检测和修复UVR辐射引起的DNA损伤[9,12]。对盐杆菌科的其他成员也做了类似的研究，对盐球菌属的研究还比较少。虽然盐球菌属实非常好的有机体来研究环境耐受性，尤其是它们独特的细胞壁组成使它们能够与很好的应对环境应激因素[13,14]。大体上而言，远古的没有细胞壁的细菌，几乎所有分类群体的细菌中（除了少数几个除外），它们的肽聚糖中含有很多的化学变化形成坚硬的细胞壁[14]。盐球菌属的细胞壁的脂类的组成是无极性的氨基糖、糖醛酸、和一种特殊的甘露糖醛酸、葡萄糖醛酸的混合物[14]。我们认为它们有能力生存与不理的环境条件下，例如低盐（NaCl）环境[15]，地下盐矿床 [16]以及模拟火星大气[17,18]。此外，目前的研究比较感兴趣的物种，我们从现代叠石层中分离到了嗜盐菌，它们能够在高强度的UVR环境下很好的生长[19]。 生存与高的UVR水平下需要依赖于3种因子：回避，防护以及修复能力 [20,21]。有机体会使用沙，蒸发岩以及其他形式的屏蔽无来保护自己免受太阳辐射的损伤[22]。例如，当有1mm后的岩石的覆盖有机体就可以生存与高剂量的UVC辐射下[23,24]。对于有机体来说，保护作用是一种刺激重要的关键因子，例如一些蓝细菌，它们能够产生类胞素类氨基酸（MAAs）以及色素scytonemin来保护他们免受310nm-370nm长度的UVR射线的影响[25,26]。 修复UV诱导的损伤时第三种关键因子，它可以使有机体重建遗传信息成为可能。UV诱导的DNA损伤包括，DNA链的断裂，由于UVB或者UVC辐射直接影响产生的光产物，或者通过活性