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图形的旋转与缩放 检查结构错误和整理结构式 根据化合物名称得到结构式 根据结构得出化合物命名 预测核磁共振化学位移 分子结构估计性质 元素周期表 符号、字体和颜色 快捷菜单和快捷键 绘制化学反应式 绘制实验装置 执行【Structure】/Check Structure】功能自动执行 执行【Structure】/【Convert Name to Structure】菜单命令 如aspirin、EDTA、morphine、2-acetoxybenzoic acid等 2.2.2 结构绘制功能 1. 简单的无机反应式和有机分子式 ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用“Formula” 进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增 强。 2. Fischer(费舍尔)投影式 3. Haworth(霍沃思)投影式 4. Newman(纽曼)投影式 5. 立体化学 1. Fischer(费舍尔)投影式 文本工具 单键工具 下图为葡萄糖分子的Fischer投影式 首先使用单键绘制工具建立主碳链接,重点是要确保下一个单键紧接在上一个单键的下面(鼠标会提示)。完成后仍然使用单键绘制工具建立其他C—H和C—OH键,也要保证每个键之间的链接点,最后使用文本输入工具输入文字,View菜单的Analysis Window功能可以提供一些当前结构的简单信息 这根直线其实是五个单键连起来的 2. Haworth(霍沃思)投影式 下图为α-D-葡萄糖的Haworth投影式 绘制这个图形使用单键、文本、楔键 等工具和对象的旋转、缩放等操作 首先建立一个六元环(环己烷),选中六元环并旋转90度(用鼠标或Object菜单的Rotate命令),用文本输入工具把六元环中的一个碳原子变为氧原子,然后使用单键工具栏建立其他化学键。 关键在于第五个碳原子的向下方向的键,为了避免与其他键交叉需要按住Alt键再绘制。接着选中整个图形,按住Shift键进行缩放(不对称缩放),把高度缩小至50%,用文本输入工具输入相应的基团,再用楔键工具修改即可 使用单键工具按住Alt键绘制,适当减少长度以免与下面的键接触 3. Newman(纽曼)投影式 Newman投影式绘制相对比较简单。 关键在于化学键的叠放顺序(图层相互覆盖的问题),方法是选中一部分对象,按鼠标右键选择Send to Back和Bring to Front以改变其层次关系。 4. 立体化学 下图中的四个结构式是同一种物质 第二个图形是使用Object菜单的ShowStereochemistry 命令建立的 第三个图形是第二个图形水平反转的结构 第四个图形是第三个图形垂直旋转180度的结果 为了出现Rotate180 Vertical,这个菜单项需要同时按住Alt键 2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 ChemDraw提供了核磁位移的估计计算,可以在 选定分子后在Estimate菜单选择1H NMR Shift或1C NMR Shift,相应给出分子各个H或C的位移。列表 给出详细资料: 心血管药物心得安(propranolol) 执行【Structure】/【Predict 1H-NMR-Shift】菜单命令 执行【Structure】/【Predict 13C-NMR-Shift】菜单命令 分别执行【View】/【Show Analysis Window】和【View】/【Show Chemical Properties Window】菜单命令 执行【View】/【Show Period Table Window】菜单命令,并可以得到该元素的物理性质 执行【View】/【Other Toolbars】/【Clipware,Part1或Part2】菜单命令 绘制实验装置图 可以用磨口玻璃仪器接插件迅速搭建化学反应装置 2.2.4 ChemProp—— 分子物理化学性质计算和标准命名 ChemDraw绘制轨道的方法是使用轨道绘制工具箱,这个工具箱能够绘制s轨道、σ轨道、单瓣轨道、p轨道、杂化轨道、d轨道和dz2轨道。每种轨道都包括有三种填充类型:背景色、阴影和纯色,具体的颜色则可以自己设置。下图是一个例子: 7.2.5 原子轨道图与分子轨道图的制作 2. 3 Chem3D的使用 Chem3D是与ChemDraw配合使用的软件,主要是为了打开三维结构,再使用各种量子化学软件计算和预测该结构的各种性质。 它能很好地同ChemDraw一起协同工作,ChemDraw上画出的二维结构式可以正确地自动转换为三维结构, Chem3D中α-D-葡萄糖的显示效果图 垂直工具栏 模型窗口 旋转柄 旋转柄 旋转柄 线状模型 棒状模型 球棍模型 圆柱键模型 比例模型 建立3D模型的方法
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