2010年工作规划-CNCP-2018交联质谱.pptVIP

最下面这一行，是我们常规的流程，也就是我们上面宣称的， 从第三行到第二行，我们缩减了谱图的数目，速度提升约10倍 从第二行到第一行，我们缩减搜索空间，速度提升了约17倍， 综合下来，我们可以宣传：干、湿技术结合：速度提升了160倍 * 我们第一版pFind在2003年问世，13年期间，我们发展了各种质谱数据处理软件。2016年，我们计划发布pFind pLink pGlyco和pAnno * 也就是我要报告的第二部分内容 * 先打一个比喻，最近几年的手机技术发展史，可以分为iPhone4之前和iPhone4之后 * 我们的交联鉴定 也可以分为2012年之前和2012年之后 2012年，我们和ruedi实验室同期发表了文章，报告了交联肽段鉴定的FDR计算公式 * 也就是 对交联肽段 一正一反 反反 正正结果的比例是 2:1:1 * 那么 对pLink1来说，最大的贡献是可以估计FDR * 而从pLink1到pLink2，主要改进有3点，分别是 * 我们先看谱图预处理，具体来说，就是确定母离子的单同位素峰 这里分别是一个单肽的一级谱图信号 和 一个交联肽段或者说双肽的一级谱图信号 双肽的质量更大，单同位素峰更低，同位素峰数目更多，确定单同位素峰更困难 * 我们在pLink1中，使用了大窗口的搜索策略。即便二级谱图中记录的单同位素峰是错误的，我们也能确保正确答案在候选空间内