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染色质结构与基因活化 活性染色质及其主要特征 染色质结构与基因转录 一、活性染色质及其主要特征 活性染色质(active chromatin)与 非活性染色质(inactive chromatin) 活性染色质的主要特征 Ⅲ .活性染色质在组蛋白修饰上的特异性 甲基化、乙酰化(标志)、磷酸化 Questions: 如何形成活性染色质中的超敏感结构? 如何隔离活性区域与非活性区域? RNA聚合酶如何通过与组蛋白结合的DNA模板进行转录? 疏松染色质结构的形成 Ⅰ. DNA局部结构的改变与核小体相位的影响 ?当调控蛋白与染色质DNA的特定位点结合时, 染色质易被引发二级结构的改变;进而引起其它的一些结合位点与调控蛋白的结合。 ?核小体变构因子可通过改变核小体的相位协助基因转录 Ⅱ. 组蛋白的修饰:影响转录活性 ——决定了染色质处于活性或非活性状态。 ?直接影响:改变染色质的结构(如:磷酸化) ?间接影响:使核小体变构(易位/解体等),使其他调控蛋白易于和染色质相互接触 例如:组蛋白的赖氨酸残基的乙酰化 Ⅲ. HMG结构域蛋白 HMG结构域可识别某些异型的DNA结构,与DNA弯折和DNA-蛋白质复合体高级结构的形成有关。 (二)染色质的区间性 ?基因座控制区(locus control region,LCR) ?染色体DNA上一种顺式作用元件,具有稳定 染色质疏松结构的功能; ?与多种反式因子的结合序列可保证DNA复制 时与启动子结合的因子仍保持在原位。 ?隔离子(insulator) ?概念:处于抑制状态与活化状态的染色质结构域之间、能防止不同状态的染色质结构特征向两侧扩展的染色质 DNA序列。 ?作用:作为异染色质定向形成的起始位点; 提供拓扑隔离区;涉及追踪机制。 (三)染色质模板的转录 ?基因转录的模板不是裸露的DNA,染色质 是否呈疏松结构,即是否处于活化状态是决定转录功能的关键 ?转录的“核小体犁”(nucleosome plow)假说 RNA聚合酶被认为是用“核小体犁”(如前面提到的SWI/SNF复合物)来解除组蛋白和DNA间的相互作用。 * 主讲人:黄曼丽 组员:吴丽、郑苑琼、李文锐、李婷婷、方晓丽、高宁英、马洁娜、华玲燕、李威、吴翠玉、庄伟志、周骏腾 一 二 染色质 核酸 蛋白质 少量RNA DNA 组蛋白 非组蛋白 核小体 阻断了转录的进行 (一) (二) ?活性染色质:具有转录活性的染色质 ?非活性染色质:没有转录活性的染色质 ?活性染色质的核小体发生构象改变,具 有疏松的染色质结构,从而便于转录调 控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合 酶在转录模板上滑动。 (一)活性染色质(active chromatin)与 非活性染色质(inactive chromatin) Ⅰ.活性染色质具有DNase I超敏感位点(DNase I hypersensitive site,DHS): ?活性染色质对DNase具有优先敏感性。 ?超敏感位点是一段长100~200bp的DNA序列特异暴露的染色质区域。 ?大部分位于5‘-端启动子区。可能是为RNA聚合酶、转录因子或其他蛋白调控因子提供结合位点。 (二)活性染色质的主要特征 Ⅱ. 活性染色质在生化上具有特殊性 ?活性染色质很少有组蛋白H1与其结合; ?活性染色质的组蛋白乙酰化程度高; ?活性染色质的核小体组蛋白H2B很少被磷酸化 ?活性染色质中核小体组蛋白H2A在许多物种很少有变异形式; ?组蛋白H3的变种H3.3只在活跃转录的染色质中出现 ?HMG14和HMG17只存在于活性染色质中。 (二)活性染色质的主要特征 (二)活性染色质的主要特征 二、染色质结构与基因激活 (一) (二) (三) 染色质的区间性 染色质模板的转录 (一) 核小体易位使得转录因子能与DNA结合: 有些细胞具有某些“工具”(如人类细胞的SWI/SNF复合物)能撬开被核小体阻断的DNA区域,从而允许转录因子与DNA接触。 (一) *
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