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生物数据库资源及其应用 中山大学生科院 2004年9月 主要内容： 基因组数据库的相关背景。 主要的基因组数据库资源。 GenBank序列数据库。 －－ GenBank序列格式。 相关资源的应用介绍。 －－序列查询（Entrez and SRS） －－序列提交（BankIt and Sequin） 基因组数据库的发展历史 从历史上来看，蛋白质数据库是先于核苷酸数据库出现的。早在60年代初，Dayhoff和他的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列，这就是“蛋白质序列与结构图册”（Dayhoff et al., 1965）。这一蛋白质数据库后来成为PIR（George et al., 1997）。这个在1965年可以很容易地存放在一张软盘上的数据集（尽管那时并不存在软盘这种存储介质），是一小群人多年的工作成果。今天，任何一个DNA或蛋白质数据库每天增加的数据量都数倍于此。 基因组数据库的发展历史（续） DNA序列数据库最早于1982年在欧洲分子生物学实验室诞生，随即就开始了一个数据库爆炸的时代。（如下图） 此后不久因一项NIH与洛斯阿拉莫斯国家实验室的合同而诞生了GenBank。 日本的DNA数据库（DDBJ），在几年后加入了数据收集的合作。 基因组数据库的发展历史（续） 1988年一次三方会议之后（现在称之为“国际DNA序列数据库合作计划”）达成了一项协议