2015-4多重序列比对及Clustal应用.ppt

* 将序列多重比对转化为序列两两比对，逐渐将两两比对组合起来，最终形成完整的多序列比对。 * * Gonnet打分矩阵：根据最新的序列数据，采用PAM矩阵的方法修改后得到的打分矩阵 * Paired－end reads：末端匹配的序列 * 考虑用拼接软件phrap？ * gi|6359019|gb|AI064747.1|AI064747 HA0508 Human fetal liver cDNA library Homo sapiens cDNA, mRNA sequence CGATTATGACCATCTTCAAGCGCCGCCGCTCGGTGCCCACTAACAAGGTGTGTTTTGATTGTGGTGCCAA AAATCCCAGCTGGGCAAGCATAACCTATGGAGTGTTCCTTTGCATTGATTGCTCAGGGTCCCACCGGTCA CTTGGTGTTCACTTGAGTTTTATTCGATCTACAGAGTTGGATTCCAACTGGTCATGGTTTCAGTTGCGAT GCATGCAAGTCGGAGGAAACNCTAGTGCATCTTCCTTATTTCATCAACATGGGTGTTCCACCAATGACAC CAATGCCAAGTACAACAGTCGTGCTGCTCAGCTCTATAGGGAGAAAATCAAATCGCTCGCCTCTCAAGCA ACAC