第四章 真核生物基因组结构教学课件.pptVIP

血红蛋白（ Hb ） 发育过程中的珠蛋白的亚基组成 两种亚基的编码基因分别形成两个不同的基因簇,并存在于不同的染色体上。 每个基因簇中的基因按其在发育过程中的表达次序从5’→3’排列在编码链上(其中包括有功能的基因和假基因) α2γ2 2% 97% 1% 类α链 类β链 3.假基因（ Pseudogenes ）： 概念：基因组中存在的一段与正常基因非常相似但不能表达的DNA序列。 分为两大类： 一类保留了相应功能基因的间隔序列； 另一类缺少间隔序列，称为加工过的假基因或返座假基因。 假基因(pseudogene)具有与功能基因相似的序列，但由于有许多突变以致失去了原有的功能，所以假基因是没有功能的基因，常用ψ表示。 大部分假基因在染色体上都位于正常基因的附近，但也有位置在不同的染色体上的。 假基因和正常基因的结构上的差异包括在不同部位上的程度不等的缺失或插入、在内含子和外显子邻接区中的顺序变化、在5’端启动区域的缺陷等。这些变化往往使假基因不能转录形成正常的(mRNA)，从而不能表达。 产生方式： 复制（duplication） 　　即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为未加工假基因或复制假基因 。 返座（retrotransposition） 　　即mRNA转录本经过反转录为cDNA,再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被称为已加工假基因或返座假基因。 二、基因簇（gene cluster ） 概念：基因家族中来源相同、结构相似和功能相关的在染色体上彼此紧密连锁的一组基因。 它们属于同一个祖先的基因扩增产物，也常常包括一些没有生物功能的假基因。 如：编码催化同一新陈代谢途径的不同步骤的酶的结构基因 。这些基因各自编码的酶常能组成多酶复合物。 细菌同一操纵子中的几个结构基因也可称为基因簇 。 串联重复基因簇的特点： 各成员之间有高度的序列一致性 拷贝数高 : 几十 ～几百 非转录的间隔区短而一致 组蛋白基因、rRNA 基因和 tRNA基因往往以串联重复基因簇的形式出现。 正好满足细胞对组蛋白、rRNA 和 tRNA的 的大量需求。 由完全相同的基因簇成员所构成。 1.串联重复序列 a. rRNA 基因家族 （rDNA gene family） 海胆 450copies 烟草 750 copies 果蝇 100 copies T 18s T 5.8s T 28s NT 18s T 5.8s T 45s 41s 20s 32s 28s 5.8s 18s 重复单位的组织情况： 一个重复单位内的转录的间隔区（内元） 重复单位之间的不转录间隔区 其中，C是单链DNA在t时刻的浓度。 k＝复性速度常数 三、真核生物基因组的非重复序列和重复序列 DNA复性动力学 DNA的复性过程遵循二级反应动力学。 DNA复性过程中复性的速度用公式表示：　　　　 dC/dt= -kC02　 对上式积分后重排，得出复性动力学方程： C／C0＝1／（1＋ k C0t） C0为单链DNA的起始浓度，C为单链DNA在t时刻的浓度，单位mol/L。 t为复性时间,单位为s（秒）。重组速率常数k的单位为L/mol，取决于阳离子的浓度、温度、片段大小和DNA序列的复杂性。 当 C/ C0 = 1/2 时的C0t值定义为C0t1/2 C / C0 = 1/2 = 1 / (1+ k C0t(1/2)) Cot(1/2) = 1/k (mol. Sec / L) 即复性反应完成一半时 在控制反应条件（初始浓度、温度、离子强度、片段大小）相同的前提下，DNA分子的C0t (1/2)值，取决于核苷酸的排列复杂性。 DNA序列的复杂度(complexity) X：最长的没有重复序列的核苷酸对的数值。 AAAAAAAA X = 1 ATCGATCGATCG X = 4 N= 105 X = 105 DNA序列的复杂性、初始浓度、片段大小、温度、离子强度 DNA复性的影响因素： X= k Cot1/2 相同核苷酸数量的DNA，复杂性小的DNA分子复性快，Cot (1/2)值小；复杂性大的DNA分子复性慢，Cot (1/2) 大。 Cot曲线：表示复性速度与DNA顺序复杂性的关系。 Cot(1/2) = 1/k (mol. Sec / L)