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剪接所需要的因子 需要的剪接因子:分子量较小(106-185bp)的核 内RNA(snRNA)(U1,U2,U5和U4/U6)及与之结合的核蛋白 (snRNPs,ribonucleo-protein particle) 3.2 RNA的转录后加工/修饰 转录后的加工(posttranscriptional modification) :经过一定程度的加工使初级转录产物变为成熟的转录物 (1)减少部分片段:如内含子的剪接; (2)增加部分片段:5′加帽,3′加poly(A),通过编辑加入一些碱基; (3)对某些碱基进行甲基化等修饰。 第一节 tRNA和rRNA的加工 一,原核生物tRNA和 rRNA的加工 参与蛋白质合成的tRNA和rRNA都不是最初的转录产物 (1)它们的5′端都是单磷酸,而原始的转录产物5′应是三磷酸; (2) 成熟分子比初始转录物小; (3) tRNA含有特殊的碱基,这些碱基只有通过一些化学修饰才可以得到。 在E.coli中rRNA有7个转录单位,名为rrnA-G,每个转录单位都含有16S、23S、5S RNA及一个或几个tRNA。但tRNA的数量,种类及位置都不固定,或在16S RNA和23rRNA之间的间隔序列中,或在3′端5S rRNA之后。每个转录单位中含有等比例的16S、23S、5S RNA是很有意思的,因为它们仅存在于核糖体中且是等比例的,因此串联转录单位保障了它们的等量关系。 加工 RNA酶Ⅲ对转录初始物切割 再加工成熟 (一) 原核生物rRNA的加工 rRNA的加工 (二) tRNA的加工 tRNA的加工分成3个阶段 (1) “斩头”: 形成5′末端; (2) “去尾”: 形成3′-OH末端。缺CCA的tRNA要用tRNA 核酸转移酶加-CCA。 (3)修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等 进行修饰,如氨基酸臂的4-硫尿苷(4tu),D臂的2甲基 鸟苷(2mG),TψC臂的假尿苷(ψ)和反密码子环上的 2异戊腺苷(2ipA) 原核的tRNA初始转录本多为多顺反子(polycistron), 也就是几个tRNA分子串连在一起,这有三种不同的情况 ①串联的tRNA分子都是相同的 ②串联的tRNA分子是不同的 ③由tRNA和rRNA串联组成。 二 真核生物tRNA和rRNA的加工 (一) tRNA的加工: (1)真核的前体分子tRNA是单顺反子,但成簇排列,基因间有间隔区; (2)真核tRNA基因一般都比原核tRNA基因多得多,如酵母约有400个tRNA基因; (3) 5′端单磷酸核苷酸,表明已被加工过; (4) tRNA的前体分子中含有内含子 如图。 tRNA的加工 碱基修饰 3’端 5’端 切除反密码环 的内含子 转位 --- Tψ 脱氨 --- AMP IMP 还原 --- DHU 甲基化--- mA mG CCA-OH RNaseP切除多余的核苷酸 RNaseP 在前tRNA二级结构基础上 首先核酸酶将内含子-外显子边界切断,产生2-3环状磷酸和5-羟基末端,接着环状磷酸被打开产生3-羟基和2-磷酸,5-羟基被磷酸化。内含子释放出来后,剩下的tRNA半分子折叠成 一个含5-磷酸及一个3-羟基裂口的类tRNA的结构,最后裂口被连接酶缝合 tRNA的剪接 真核tRNA的加工和原核的区别 (1)真核tRNA前体中无二聚体和多聚体; (2)增加了剪接内含子的过程; (3)都要加CCA。 (二)真核生物rRNA的加工 真核生物rRNA的基因 (rDNA) 转录产物 成簇纵列串联排列 高度重复序列DNA 核质:(Ⅲ)--不需加工 5s rRNA 核仁:(Ⅰ)--加工 5.8s rRNA 28s rRNA 18s rRNA 真核细胞中rRNA的加工途径 (1) 切除5′端的前导序列; (2) 从41S的中间产物中先切下18S的片段。 (3) 部分退火,形成发夹结构; (4) 最后修正。 第二节 mRNA的剪接 一,原核生物mRNA的加工 mRNA的前体为核内不均一RNA(heterogenous nuclear RNA,hnRNA)平均分子长度为8-10Kb (2Kb-14Kb)左右。比mRNA的平均长 度(1.8-2Kb)要大 4-5倍。hnRNA仅有总量的1/2转移到细胞质内,其余的都 在核内被降解掉。 hnRNA是mRNA的前体,证据是: (1) hnRNA和mRNA有相同的序列; (2) hnRNA在体外能作为模板翻译蛋白; (3) 两者5′端都有帽子结构; (
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