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异硫氰酸胍一步法提取总RNA
【试剂配制】
1、变性液D:4M异硫氰酸胍(Quanidine thiocyanate),25 mM柠檬酸钠(Sodium Citrate),0.5% N-月桂酰肌氨钠(Sarkosyl),0.1 M β-巯基乙醇(β-Mercaptoethanol);
2、2M 醋酸钠(NaAc),pH4.0;
3、水饱和酚(Phenol, H2O saturated, pH4.0);
4、49:1 氯仿/异戊醇(Chloroform/Isoamyl alcohol);
5、100%异丙醇(Isoproponal);
6、75%乙醇(Ethanol),用DEPC处理水配制;
7、DEPC处理水(DEPC-treated H2O);
以上试剂均4℃
【操作方法】
1、收集培养细胞置1.5mL Ep管中,至细胞量达到106~107,弃掉培养基,加入500μL变性液D,充分震荡,混匀,使细胞充分裂解;若是组织,取组织约100mg,加入500μL变性液D,在匀浆器中研磨匀浆,转移至1.5mL Ep管;
2、加入50μL 2M醋酸钠(pH4.0),颠倒混匀;
3、加入500μL 水饱和酚和100μL 49:1的氯仿/异戊醇,充分混匀,置于冰浴10min;(可见有乳白色的乳浊液形成,至于冰上一会可见有不清晰的分层,若是澄清液体,则再加入50μL 49:1的氯仿/异戊醇,充分混匀)
4、14,000g,4℃,离心10min,小心将上层水相转移到新的1.5mL Ep管中;(样品分为三层,上层含RNA的水相,下层含DNA的酚相,中间变性的白色蛋白质,取200μL枪调到150μL,大约能取3次,约共450μ
5、加入等体积100%异丙醇,置于-20℃
6、14,000g,4℃,离心15min,弃掉液体,在吸水纸上倒扣吸净残余液体;
7、加入700μL 75%乙醇,颠倒Ep管,洗RNA沉淀,14,000g,4℃,离心5min,弃掉液体,再用75%乙醇洗一遍;(RNA沉淀在75%乙醇中不会溶解,颠倒两下即可;可以将RNA在75%乙醇中储存于-80
8、将Ep管置于室温(或50~60℃加热干燥),使管内的乙醇充分挥发掉,加入适量(约30μL)DEPC处理水溶解RNA,10μL分装,-80
【注意事项】
操作过程要尽可能降低RNase污染,保持环境清洁,佩戴一次性口罩、手套,所用Ep管、枪头均经过1‰DEPC水溶液过夜浸泡,高压灭活,烘干后使用。
(为减少DEPC对身体的伤害,Ep管、枪头高压消毒2~3次即可使用,避免冲管口说话,前面几步要快,特别是组织匀浆时,要快)
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