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细胞总蛋白提取
准备:
1、冰盒、提前开启低温高速离心机、预冷1× PBS、细胞刮刀、移液器(吸头)。
2、1×RIPA buffer [Thermo (89901)]、100×Cocktail [CALBIOCHEM (#539131)]、100×PMSF [Beyotime (ST506-2)]、10×Phosstop [Roche (4906837001)] (Cocktail 和Phosstop 分装储存于-20℃,需提前置于冰上解冻,根据xuyao)。Cocktail和Phosstop的配制方法为:1粒药片加入1ml RIPA buffer [Thermo (89901)],分别配成100X Cocktail 和10X Phosstop。
PMSF:丝氨酸蛋白酶抑制剂, -20℃保存1年。
Coaktail:抑制丝氨酸、半胱氨酸、金属蛋白酶;2- 8°C保存1-2周,-20°C可保存至少1个月。
PhosSTOP可同时持续抑制包括酸性和碱性磷酸酶,及丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP1, PP2A, PP2B)和酪氨酸蛋白磷酸酶在内的多种磷酸酶。溶解后的储存液体4℃可以稳定保存一个月以上,-20℃下可以保存6个月。
【注意】PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。
3、标记并预冷1.5ml离心管(样品数)、0.5ml离心管(样品数)、0.2ml离心管(样品数)。
样品:
1、根据实验需求干预细胞,蛋白提取前用显微镜拍照记录细胞数量及状态(用于评估需要裂解液的量和Western Blot数据分析参考)。
举例:HCT-8细胞接种于2块6孔板中,用PZH干预24h后,对照组细胞汇合度约为80%时,PZH 0mg/ml、0.25mg/ml、0.5mg/ml、0.75mg/ml所需加入裂解液的体积为60μl、60μl、60μl、50μl,即所需加入孔中裂解液总量为690μl,所配量比所需份数多2-3份,预计所配量为800μl(1× RIPA Buffer 704μl + 100× Cocktail 8μl + 100× PMSF 8μl + 10×Phosstop 80μl、),剩余裂解液另存于离心管中保存于-20度,供测定BCA时使用。提取在冰上操作及试剂置于冰上保存。
6 well plate
裂解液60μl
PZH 0mg/ml
裂解液60μl
PZH 0mg/ml
裂解液60μl
PZH 0mg/ml
裂解液60μl
PZH 0.25mg/ml
裂解液60μl
PZH 0.25mg/ml
裂解液60μl
PZH 0.25mg/ml
6 well plate
裂解液60μl
PZH 0.5mg/ml
裂解液60μl
PZH 0.5mg/ml
裂解液60μl
PZH 0.5mg/ml
裂解液50μl
PZH 0.75mg/ml
裂解液50μl
PZH 0.75mg/ml
裂解液50μl
PZH 0.75mg/ml
2、移去培养液,用1ml预冷的1× PBS洗细胞,移去PBS,倾斜置于冰上。(例:6孔板PBS量:0.5ml)
3、按上述需要配好裂解液,把裂解液加到孔中(宁少勿多),立即用细胞刮刀(6孔板可用200ul tips刮,不同孔换tips)把细胞刮到一角,把液体收集到1.5ml离心管中,置于冰上。
4、每隔5min涡旋震荡一次,使细胞完全裂解。
5、15min后,4℃、14000rmp离心20分钟。
6、把上清液转移到新的0.5ml离心管中,置冰上。用0.2ml离心管分装3μl蛋白供BCA测定时使用。所有蛋白置于-80℃保存。
注意事项:
1、低温可避免蛋白降解,所有离心管需预冷。
2、PBS要吸干,但避免细胞干掉,以免使蛋白浓度过低。
3、整个蛋白提取过程要快,这能保证干预的效果。
4、若时间允许,可以立刻进行BCA定量,可省一套0.2ml离心管。蛋白要避免反复冻融,提取后立刻测定BCA的蛋白可以根据所测定浓度以每管75μg分装(即每次所需量50μg的1.5倍,注意加入的5×loading也为1.5倍);未测定BCA前可以分装成2份,置于-80℃保存。根据实际情况而定,建议药物干预时间合理安排,在上午或中午进行蛋白提取,下午则可接着进行BCA定量;但需要提取不同时间点蛋白时,则可将所有时间点蛋白提取好之后再同一次进行BCA定量实验。
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