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LAMP技术原理及应用
陈 蕾
北京蓝谱生物科技有限公司
E-mail: chenlei@
Tel: 0101
Mob:1
基因检测的流程
从样本中抽取、提纯
DNA、RNA
PCR
LAMP
一步反应 二步反应
基因扩增
扩增
扩增
检测
检测
检 测
2
LAMP法和PCR法的比较
LAMP PCR
温 度 ◎ 反应全程恒温 △ 必须要有热循环
时 间 ◎ 约15~60分钟 △ 2~3小时
产 物 量 ◎ 约1010倍 (100亿倍) △ 约107倍 (1千万倍)
特 异 性 ◎
极高
6区域 4 引物
△ 2区域 2 引物
无需其他检测步骤,
检 测 ◎ 根据扩增反应发生与 △ 需其他检测步骤
否判断
试 剂 ◎ 无需特殊试剂 ◎ 无需特殊试剂
简单、快速、准确的基因扩增法
3
LAMP法的引物设计
4
LAMP法使用的酶
链置换型DNA聚合酶: Bst DNA Polymerase
?扩增对象为双链DNA时,其中一条链解离的同时进行链伸长。
?LAMP法使用最适温度65℃的聚合酶。
引物 双链DNA
聚
引物
聚
双链DNA解离的同时???
①
②
解离下来的单链DNA
引物
聚
持续链伸长 ③
5
LAMP法的原理 ①
(4) 哑铃状模板构造的形成过程
3’ F3c F2c F1c B1 B2 B3 5’
3’ F3c F2c F1c Target DNA B1 B2 B3 5’
5’ 3’
F3 F2 F1 B1c B2c B3c
+
5’ 3’
w解离链
5’ F3 F2 F1 B1c B2c B3c 3’ F1c F2 F1 B1c B2c B3c
(1)
3’ F3c F2c F1c B1 B2 B3 5’
F1c
5’
F2 3’
FIPw结合
(5)
(6)
F1 B1c B2c B3c 3’
5’ B1c
F2
3’ B2
5’
F1c
w环状构造
BIPw结合
5’ F1c F2 F1 B1c B2c B3c 3’
(2)
3’
F3c F2c F1c B1 B2 B3 5’
5’ F2 F1 B1c B2c B3c 3’
F1c
(7)
B3 Primer
3’
F1 F2c F1c
B2
B1c
5w’ 结合
5’ F1c F2 F1 B1c B2c B3c 3’
(3)
3’ F3c F2c F1c B1 B2 B3 5’
F2 F1 B1c B2c B3c 3’
F1c
5’
F3 Primer
w结合
(8)
3’ 5’
F1 F2c F1c B1 B2 B3
+
F1c B1
w解离连
B2
F2c
5’
3’
F1 B1c
w环状构造 w环状构造
6
LAMP法的原理 ②
扩增循环
(8)
B1
F1c
F1
F2
F1
B1c
F1c
F1c FIP
F2c B1
B2
F1 B1c
B2c
F1c
F2c F2 B2 F2c F2
F1c
F1
FIP
B1c
F1c
B1
(9)
F1c B1 B2 B1c F1c F2 F1 B1c
F2c
F2
F1
F1c
B1c
B1
B2c B1 F1
F2c
F1c
F1
B1
B2
B1c
B2c
B2 B2c F2c F2
F1 B1c F1c B1
F1c B1 B2 B1c
F1 B1c
F2c F2
F1
F1c
B1c
BIP
B1
B1c
B2
B2c
B1
B2c
F2
F1c B1
BIP
B2
B1c
B2c
F1
B1c
(10) (11)
7
アニメーション
8
环引物的应用 ①
F1c
(8) Loop Primer B
B1
F2
F2c
F1
3’ 5’
B1c B2 F1c
Loop Primer F
(11) F1
B1c
F2
5’
F1c 3’ B1
B2c
B2
B1c
9
环引物的应用 ②
RNA
PSA
癌症转移标志基因
CYP2C19
公牛特异性序列
DNA
HBV
λDNA
快速法(Loop Primer :有)
标准法(Loop Primer :无)
10
LAMP法结果判断方式① ----目视检查混浊
dNTPs
DNA Polymerase
Mg2+, DNA
DNA-(dNMP)n + nPPi
PPi = P2O7
P2O74- + 2 Mg2+ Mg2P2O7
( White precipitate)
LAMP法结果判断方式① ----目视检查混浊
dNTPs
DNA Polymerase
Mg2+, DNA
DNA-(dNMP)n + nPPi
PPi = P2O7
P2O74- + 2 Mg2+ Mg2P2O7
( White precipitate)
LAMP法结果判断方式②
UV
----
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